桃Ⅱ型NADH脱氢酶家族基因鉴定和表达分析

文献类型： 中文期刊

第一作者： 张春华

作者： 张春华;沈志军;马瑞娟;张圆圆;郭绍雷;蔡志翔;俞明亮

作者机构：

关键词： 桃;Ⅱ型NADH脱氢酶;基因家族;基因表达

期刊名称： 江苏农业学报

ISSN： 1000-4440

年卷期： 2022 年 38 卷 004 期

页码： 1049-1061

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： Ⅱ型烟酰胺腺嘌呤二核苷酸脱氢酶(TypeⅡNADH dehydrogenase)在所有已全基因组测序的植物中均存在,具有多种功能,尤其在大多数植物呼吸链中起重要作用.本研究对桃Ⅱ型NADH脱氢酶家族基因进行了鉴定,确定了桃Ⅱ型NADH脱氢酶基因家族成员数目、亚家族分类,并分别进行了克隆,同时分析了它的进化关系、在基因组骨架上分布、启动子区域、基因结构、不同组织表达水平及其编码的蛋白质结构.结果显示,桃Ⅱ型NADH脱氢酶基因家族共有6个成员,分布在3~6号染色体上,被分为3个亚家族:NDA、NDB、NDC.桃Ⅱ型NADH脱氢酶家族成员,脂肪族氨基酸指数范围是80.63~95.75,等电点预测结果表明Prupe.3G231400.1和Prupe.5G076700.1是酸性蛋白质,其余4个是碱性蛋白质;NDA和NDC亚家族成员二级结构均以无规则卷曲为主要构成元件,NDB亚家族成员二级结构均以α-螺旋为主要构成元件.Ⅱ型NADH脱氢酶家族基因在桃不同组织中的表达水平差异较大,5个基因在老叶中表达量相对较高,在成熟果肉中表达量低.这些结果为下一步进行Ⅱ型NADH脱氢酶基因功能验证奠定了重要基础.

分类号： S662.1

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