猪繁殖与呼吸综合征河南毒株Henan-1的分离及其NSP2、ORF3、ORF5的序列分析

文献类型： 中文期刊

第一作者： 张彩勤

作者： 张彩勤;王旭荣;杨增岐;赵炳武;宋长绪

作者机构：

关键词： 猪繁殖与呼吸综合征病毒;Henan-1毒株;序列分析

期刊名称： 西北农业学报

ISSN： 1004-1389

年卷期： 2008 年 17 卷 01 期

页码： 1-6

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： 将2007年1月河南省某猪场送检的疑似高热病病料处理后接种于Marc-145细胞,出现细胞聚集、固缩、脱落等特异性细胞病变。根据GenBank中猪繁殖与呼吸综合征病毒(PRRSV)的基因序列设计并合成针对NSP2、ORF3和ORF5基因的引物,RT-PCR扩增目的基因并将其克隆入pMD18-T载体进行测序。并与国内外已发表的毒株的序列进行比较。结果表明:分离毒株Henan-1是美洲型PRRSV,而且NSP2基因发生30个AA的不连续缺失;Henan-1的NSP2、ORF3和ORF5基因与JXA1、JX0612、HZ-X、HB-1(sh)、CH-la、HB-2(sh)、SP、ATCC VR-2332、Henan-HN1、Resp PRRS/Repro MLV、PA8、BJ-4等毒株等位基因的核苷酸同源性分别为83.0%~99.0%、88.3%~99.2%、88.6%~99.5%,推导的氨基酸同源性分别为66.7%~97.9%、84.7%~98.8%8、7.1%~99.5%;而ORF3和ORF5基因与LV4.2.1等位基因核苷酸同源性分别为64.7%和64.2%,推导的氨基酸同源性分别为56.7%和61.0%。基因系统发育树分析表明:Henan-1与JXA1J、X0612株的亲缘关系很近,与HB-1(sh)亲缘关系较近,与HZ-X、CH-la、HB-2(sh)、SP、RespPRRS/Repro MLV等毒株处于不同的分支。

分类号： S852.65

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