口蹄疫病毒株OA／583C蛋白酶的结构模拟和功能分析

文献类型： 中文期刊

第一作者： 周建华

作者： 周建华;丛国正;高闪电;常惠芸

作者机构：

关键词： 口蹄疫病毒;3C蛋白酶;活性位点

期刊名称： 华北农学报

ISSN： 1000-7091

年卷期： 2007 年 22 卷 6 期

页码： 9-13

收录情况： CSCD

摘要： 以口蹄疫病毒株OA／58RNA为模板，反转录并扩增目的cDNA，然后与pGEM—TEasy载体连接并转化JM109菌株，提取的重组质粒用凝胶电泳、PCR和踟RI酶切法鉴定。该毒株与Poliovirus，Hepatitis A virus和Human rhinovirus89毒株3c序列对比分析发现核苷酸序列一致性分别为38．8％，37．1％和36．5％，氨基酸序列一致性分别为23．7％，19．2％和17．6％。通过Swiss-pdbViewer软件模拟出FMDVOA／583C蛋白酶的3D结构和表面模型。并鉴定出此毒株3c蛋白酶的活性中心为Cys_(31)-His_(46)-Asp_(84)。

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