香蕉MaTPS3基因序列及表达特性分析
文献类型: 中文期刊
第一作者: 许桂莺
作者: 许桂莺;李科明;舒海燕;王安邦;常胜和;孙威;宋顺;许奕;金志强
作者机构:
关键词: 香蕉;海藻糖-6-磷酸合成酶基因(TPS3);生物信息学;表达分析
期刊名称: 广东农业科学
ISSN: 1004-874X
年卷期: 2015 年 42 卷 22 期
页码: 106-112
收录情况: 北大核心 ; CSCD
摘要: 通过随机克隆测序的方法从香蕉根系c DNA文库中获得海藻糖合成酶基因,命名为Ma TPS3。Ma TPS3扩增获得的c DNA序列全长为2 874 bp,包含一个完整的开放阅读框1 971 bp,编码蛋白含656个氨基酸。其氨基酸理化性质分析表明,Ma TPS3蛋白属于不稳定、疏水性蛋白蛋白,等电点p I6.26,具有两个结构域TPS和TPP;序列预测分析表明,Ma TPS3蛋白定位于细胞质中,该蛋白含一个跨膜区域,不存在信号肽。通过与已知植物的TPS氨基酸同源序列比对,相似性为67.31%;其中与印度水稻、蒺藜状苜蓿TPS氨基酸的进化关系较近,同源性分别为55.13%、54.71%。器官特异性分析表明,Ma TPS3在香蕉植株的根、球茎、假茎、叶、花、果实各器官中均有表达,在叶片和花中表达量较多。q PCR分析表明,盐胁迫下Ma TPS3表达量增加,于24 h时达到最高;在冷胁迫处理下,Ma TPS3表达量较0 h时则明显下调;ACC胁迫处理下,Ma TPS3表达量逐渐增加,在24 h表达量为0 h时4倍。巴拿马病菌4号生理小种(Foc4)侵染后,Ma TPS3在根系中下调表达,在24 h时表达量显著低于0 h时。因此,Ma TPS3可能参与调控香蕉抗盐胁迫机制,从而提高香蕉耐盐性,并参与调控植物激素生物合成。
分类号: S668.1
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