WSSV3个编码蛋白的基因密码子偏爱性分析

文献类型： 中文期刊

第一作者： 刘庆慧

作者： 刘庆慧;黄倢;韩文君

作者机构：

关键词： WSSV;密码子;偏爱性

期刊名称： 海洋水产研究

ISSN： 1000-7075

年卷期： 2005 年 26 卷 04 期

页码： 1-7

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： 运用EMBOSS(TheEuropeanMolecularBiologyOpenSoftwareSuite)的CHIPS(Condon HeterozygosityinaProteinCodingSequence)和CUSP(Createacondonusagetable)程序对WSSV3个编码蛋白的基因密码子偏爱性分析,分析结果与大肠杆菌、酵母及人的密码子偏爱性进行比较。结果显示,WSSV vp37、WSSV vp39及WSSV vp19的Nc(Effectivenumberofcondons)值为49.897、48.640、46.868。3种蛋白的编码密码子使用频率有较大的差异,其在大肠杆菌、酵母及人的密码子偏爱性也有不同,分析结果表明,WSSV vp37和WSSV vp39的密码子与原核生物及人的相差较大,其表达系统选择在酵母较为合适,而WSSV vp19的密码子与原核和真核生物酵母相差较大。

分类号： S945.46

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