基于BSA-seq技术挖掘糙皮侧耳抗螨候选基因
文献类型: 中文期刊
第一作者: 李辉平
作者: 李辉平;骆昕;侯子强;蒋宁;林金盛;侯立娟;徐平;马林;曲绍轩
作者机构:
关键词: 糙皮侧耳(平菇);抗螨候选基因;群体分离分析法
期刊名称: 江苏农业学报
ISSN: 1000-4440
年卷期: 2022 年 006 期
页码: 1648-1656
收录情况: 北大核心 ; CSCD
摘要: 根据前期不同糙皮侧耳菌株抗螨性差异调查结果,构建了糙皮侧耳孢子单核体群体,群体内479个菌株抗螨性呈正态分布。利用BSA-seq技术对高抗和高感混池进行SNP和InDel位点的欧氏距离关联分析,将抗螨性候选基因定位到一条染色体上,2个相邻候选区域总长度为1.75 Mb,内有基因605个,其中非同义突变基因353个,移码突变基因89个。经功能注释以及GO和KEGG通路富集等分析,发现26个候选基因参与了信号传导、防御过程和次级代谢相关通路,推测这些候选基因可能与糙皮侧耳抗螨性相关。
分类号: S646.141
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