玉米SPP基因家族的全基因组鉴定及表达分析
文献类型: 中文期刊
第一作者: 何冰
作者: 何冰;时丕彪;吕远大;陈国祥
作者机构:
关键词: 玉米(Zea mays L.);磷酸蔗糖磷酸酶;家族基因;生物信息学;表达谱
期刊名称: 分子植物育种
ISSN: 1672-416X
年卷期: 2019 年 23 期
页码: 7649-7656
收录情况: 北大核心 ; CSCD
摘要: 磷酸蔗糖磷酸酶(sucrose-phosphate phosphatase, SPP)是蔗糖生物合成途径中的关键酶,其主要作用是将蔗糖-6-磷酸水解成蔗糖。本研究利用生物信息学手段从玉米基因组中鉴定了2个SPP家族基因,命名为ZmSPP1和ZmSPP2,并从系统发育关系、蛋白结构域、基因结构和表达模式等方面分析了该基因家族的特征。结果发现,ZmSPP基因在基因结构上存在明显差异,但其编码蛋白的理化性质高度相似,并且均含有S6PP结构域和S6PP_C结构域。表达谱分析显示,ZmSPP在玉米各组织中均有表达,但ZmSPP1的表达水平显著高于ZmSPP2,这暗示ZmSPP1可能在玉米蔗糖-6-磷酸水解过程中扮演重要作用。进一步分析授粉阻断后的叶片RNA测序数据,结果表明阻断授粉可以抑制玉米叶片中ZmSPP1基因表达,但不影响ZmSPP2基因表达。本研究将为进一步解析玉米ZmSPP基因的功能提供重要依据。
分类号: S513`Q943.2
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