猪流感病毒低密度分型芯片的试验研究

文献类型: 中文期刊

第一作者: 高淑霞

作者: 高淑霞;王文志;张伟

作者机构:

关键词: 猪流感病毒;基因芯片;多重PCR;杂交

期刊名称: 西南农业学报

ISSN: 1001-4829

年卷期: 2011 年 24 卷 06 期

页码: 2385-2388

收录情况: 北大核心 ; CSCD

摘要: 根据猪流感病毒(swine influenza virus,SIV)H1N1、H3N2、H5N1和H9N2亚型的血凝素(HA)基因序列,分别设计各亚型的特异引物,并根据A型流感病毒的M基因序列设计引物,作为4种病毒亚型的通用引物。应用RT-PCR分别扩增各病毒亚型HA基因的特异片段和M基因片段,并克隆到pMD19-T Simple Vector构建重组质粒,经测序后,用于各病毒亚型探针的制备。将各探针按一定的阵列点加到硝酸纤维素膜上,制备成低密度基因芯片。在多重PCR过程中,用生物素标记的dUTP(Bio-11-dUTP)对待检样品进行标记,扩增产物与制备的基因芯片进行杂交,最后用扫描仪进行读片和分析。结果表明,该方法可以同时检测4种SIV病毒亚型,与PCR方法相比,显示了较高的灵敏度。该方法的建立,为SIV分型和猪流感疫情的监测提供了一种快速、灵敏和高通量的手段。

分类号: S858.28

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