山葡萄种质资源DNA条形码通用序列的筛选

文献类型： 中文期刊

第一作者： 宋慧芳

作者： 宋慧芳;刘海双;杨义明;范书田;李昌禹;艾军

作者机构：

关键词： 山葡萄;DNA条形码;鉴定;ITS2;psbA-trnH;序列

期刊名称： 植物学报

ISSN： 1674-3466

年卷期： 2017 年 06 期

页码： 723-732

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： 对山葡萄(Vitis amurensis)种质资源样品的ITS、ITS2、psb A-trn H、rbc L和mat K序列进行PCR扩增及测序,优化PCR反应的退火温度,比较各序列的扩增效率、测序成功率、品种间和品种内的差异及barcoding gap图,使用BLAST和NJ树法比较不同序列的鉴定能力,最终从5条DNA片段中筛选出可用于山葡萄种质资源鉴定的DNA条形码通用序列。结果表明,在采集的11份33个山葡萄样品中,psb A-trn H和ITS2序列的扩增与测序成功率较高,其品种间、品种内差异及barcoding gap较ITS、rbc L和mat K序列具有明显的优势,且ITS2序列能够鉴别psb A-trn H序列无法鉴别的品种。实验证明,ITS2和psb A-trn H序列是较适合鉴别山葡萄资源的DNA条形码序列组合。DNA条形码弥补了形态学鉴定的不足,可为山葡萄种质资源的准确鉴定提供科学依据。

分类号： S663.1

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