枳根cDNA全长文库的构建与分析

文献类型： 中文期刊

第一作者： 姚利晓

作者： 姚利晓;王金萍;何永睿;雷天刚;许兰珍;彭爱红;邹修平;陈善春

作者机构：

关键词： 枳;根;全长c DNA文库;表达序列标签;生物信息学分析

期刊名称： 园艺学报

ISSN： 0513-353X

年卷期： 2015 年 42 卷 01 期

页码： 149-156

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： 为了解柑橘优良砧木枳(Poncirus trifoliata)根部的基因表达信息,利用SMART技术构建了枳的根组织全长c DNA文库。检测结果显示所建枳根原始文库的容量为1.08×106 cfu·m L-1,扩增后文库容量为1.30×109 cfu·m L-1,重组率为95%。通过文库随机测序获得182个长度大于100 bp的ESTs序列(Gen Bank登录号为JK316116~JK316297),序列拼接后得到96个Unigenes,包括12个Contigs和84个singletons。其中,68个Unigenes可与Gen Bank中登录的基因相匹配,56个与已知的柑橘基因相匹配,36个为全长基因。对24个全长基因完成了功能注释,并进一步开展了生物信息学分析,发现有6个应激反应基因和3个根发育相关基因。

分类号： S666

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