萝卜全基因组抽薹开花相关基因的鉴定及比较基因组学分析

文献类型： 中文期刊

第一作者： 汪精磊

作者： 汪精磊;邱杨;程锋;段蒙蒙;张晓辉;李锡香

作者机构： 中国农业科学院蔬菜花卉研究所农业部园艺作物生物学与种质创制重点实验室

关键词： 萝卜;抽薹开花;基因;拟南芥;比较基因组

期刊名称： 中国园艺学会2015年学术年会论文摘要集

ISSN：

年卷期： 2015 年

页码： 1

收录情况： CSCD

摘要： 以中国农业科学院蔬菜花卉研究所测序的萝卜36-2基因组注释信息及根、叶、薹、花、角果、愈伤组织转录组数据,以及拟南芥信息资源数据库(TAIR)拟南芥注释信息,十字花科数据库(BRAD)白菜、甘蓝基因组注释信息为基础,根据前人报道的拟南芥抽薹开花160个蛋白编码相关基因,使用blastp软件进行序列相似性搜索,使用SynOrths软件进行基因共线性分析,结合二者结果并使用MEGA6采用NJ法构建系统发育树,确定萝卜抽薹开花相关基因。(1)鉴定出萝卜抽薹开花相关基因253个,它们在萝卜各染色体分布是不均匀的,1号染色体上分布最多,占到19.43%,6号染色体上分布最少,仅占5.26%。在拟南芥16...

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