灰毡毛忍冬MADS-box基因家族AGL15基因的克隆、生物信息学和表达分析

文献类型： 中文期刊

第一作者： 易刚强

作者： 蔡嘉洛;朱贻霖;陈林;樊悦;刘峰;张亚丽;欧阳琳;刘湘丹

作者机构：

关键词： 灰毡毛忍冬;蕾期延长;基因克隆;生物信息学分析;基因表达

期刊名称： 中草药

ISSN： 0253-2670

年卷期： 2016 年 47 卷 04 期

页码： 640-647

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： 目的基于前期对灰毡毛忍冬Lonicera macranthoides转录组测序结果,从灰毡毛忍冬RNA中克隆灰毡毛忍冬MADS-box基因家族蕾期延长相关基因AGL15,并对其进行生物信息学及表达分析。方法对灰毡毛忍冬总RNA进行反转录酶链式反应(reverse transcription-PCR,RT-PCR)和c DNA末端快速扩增反应(rapid amplification of c DNA ends,RACE),获得完整的开放阅读框(ORF)。运用生物信息学的方法对该序列进行同源性分析和相似性比较,预测编码蛋白,并对其进行各种理化性质分析。运用半定量PCR测得该基因在灰毡毛忍冬不同部位的表达情况。结果获得AGL15基因,ORF长795 bp,编码264个氨基酸,与葡萄Vitis vinifera中MADS-box基因家族AGL15基因相似性最高,且包含MADS和K-box的保守序列。AGL15蛋白无跨膜区域,定位于细胞质中,在灰毡毛忍冬各部位均有表达。结论首次从灰毡毛忍冬中克隆得到可能控制蕾期延长的基因,分析了其在灰毡毛忍冬不同部位表达差异性,为灰毡毛忍冬蕾期延长研究提供参考。

分类号： S567.19

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