鸡EGFR基因的功能分析及其对颗粒细胞中基因表达的影响研究

文献类型： 中文期刊

第一作者： 陈林

作者： 陈林;王家乡;吴艳;皮劲松;蒲跃进

作者机构：

关键词： EGFR基因;转录组测序;蛋鸡;颗粒细胞;差异表达基因

期刊名称： 中国畜牧杂志

ISSN： 0258-7033

年卷期： 2025 年 61 卷 001 期

页码： 212-222,226

收录情况： 北大核心

摘要： 本文旨在研究鸡卵泡颗粒细胞EGFR基因的功能并对其过表达后进行转录组和生物信息学分析，为进一步研究EGFR基因在鸡卵泡颗粒细胞发育中的调控机制提供理论基础。利用qRT-PCR技术探索EGFR基因过表达后细胞凋亡关键基因（BCL2、c-myc、casp3）以及氧化应激相关基因（SOD2、CYP19、GPX2）的表达量，进而确定其在颗粒细胞中的功能；利用RNA-seq测序技术对EGFR基因过表达后的卵泡颗粒细胞进行转录组学分析，筛选差异表达基因，并对其进行GO和KEGG注释及qRT-PCR验证。在对照组（空载体）和试验组（EGFR基因过表达）颗粒细胞样本中分别获得2.361×107和2.399×107条Clean Reads，其中对照组和试验组共有90.61%的Clean Reads比对到鸡参考基因组上。DESeq分析发现共有1 356个基因在2组间差异表达，其中790个基因上调，566个基因下调，包括与细胞功能相关基因，如SLC2A12、HSPB9、ANO1、CCL4、HMOX1、Nurr1等。GO分析发现，差异表达基因主要富集在转录正调控、DNA模板化、含有核酸酶的化合物代谢的阳性调节以及RNA代谢的正调控等过程。KEGG通路主要富集在类固醇生物合成、溶酶体和局部粘连及细胞外基质受体相互作用等过程。GO和KEGG富集结果表明，EGFR基因过表达后，SLC2A12、HSPB9、ANO1基因表达量显著或极显著上调，CCL4、HMOX1、NR4A2基因表达量显著或极显著下调，推测EGFR基因可以通过调控颗粒细胞中相关基因及信号通路的表达，进而调控卵泡的发育。本研究为分析EGFR基因对卵泡发育的调控机制提供了理论参考依据。

分类号： S831.2

  • 相关文献

[1]基于转录组测序技术筛选影响蛋鸡产暗斑蛋候选基因的研究. 杜元军,韩海霞,刘玮,李大鹏,雷秋霞,周艳,刘杰,王杰,李福伟,陈甫. 2023

[2]基于子宫黏膜转录组研究调控蛋鸡产蛋后期蛋壳质量相关的基因和信号通路. 邵丹,瞿源,刘良基,童海兵. 2025

[3]高温诱导蛋鸡氧化损伤及对卵泡发育的影响. 杨晓岚,张敏红,冯京海,翟利利,姜礼文. 2012

[4]日循环高温对蛋鸡卵泡发育的影响. 翟利利,冯京海,张敏红. 2011

[5]双孢蘑菇6个菌株不同发育阶段的转录组分析. 施肖堃,卢园萍,蔡志欣,郭仲杰,陈美元,廖剑华. 2019

[6]基于转录组学的不同色系蝴蝶兰花色苷差异积累分析. 张加强,史小华,刘慧春,马广莹,邹清成,朱开元,周江华,毛军铭. 2018

[7]基于RNA-Seq筛选ALV-J感染汶上芦花鸡肝差异表达致病相关基因. 张会永,吴井生,杨剑波,俞燕,薛倩,殷建玫,朱云芬,朱静,苏一军,李国辉,韩威. 2020

[8]鸭胚胎发育中后期胸肌发育阻滞的RNA-seq分析. 刘宏祥,徐文娟,朱春红,陶志云,宋卫涛,章双杰,李慧芳. 2018

[9]基于瘤胃转录组探究双峰驼沙漠适应性分子机制. 方艳,周俊文,关伟军,蒋琳,浦亚斌,赵倩君,何晓红,马月辉. 2021

[10]利用RNA-Seq技术分析草鱼生长性状相关基因和SNP标记. 孙雪,李胜杰,姜鹏,杜金星,周家辉,白俊杰. 2021

[11]芝麻根系响应铝胁迫的比较转录组分析. 梁俊超,赵云燕,颜小文,颜廷献,王郅琪,孙建,饶月亮,周红英,乐美旺. 2023

[12]鸭胚胎发育中后期胸肌发育阻滞的RNA-seq分析. 刘宏祥,徐文娟,朱春红,陶志云,宋卫涛,章双杰,李慧芳. 2018

[13]基于转录组测序技术挖掘大豆蛋白质合成相关基因. 郭静文,史晓蕾,刘茜,赵青松,邸锐,刘兵强,闫龙,王凤敏,张孟臣,赵宝华,杨春燕. 2019

[14]哈茨木霉Th-33厚垣孢子形成过程的转录组变化分析. 李梅,张林,庞莉,孙青,蒋细良. 2015

[15]基于转录组测序筛选鸡皮肤毛囊性状相关基因和关键通路. 陈春,魏岳,黄聪,黎观红,谢金防,武艳平. 2023

[16]不同磷酸盐浓度下浮游虫黄藻的转录组比较分析. 李月,王云龙,欧阳珑玲. 2022

[17]长日照条件下2个热带玉米自交系的转录组差异分析. 高媛,王小利,涂亮,刘鹏飞,郭向阳,王安贵,祝云芳,吴迅,陈泽辉. 2022

[18]野生稻基因导入系W6023对白叶枯菌的抗谱及转录组差异表达基因分析. 张明伟,徐飞飞,郝巍,王春连,赵开军. 2017

[19]桃响应葡萄座腔菌侵染的转录组学分析. 刘勇,王富荣,王会良,艾小艳,朱炜,孙中海,吕亮,龚林忠,何华平. 2024

[20]转录组测序技术在猪繁殖与呼吸综合征病毒研究中的应用. 梁婉,周丹娜,彭忠,杨克礼,段正赢,郭锐,刘威,吴斌,陈文杰,孟丽,田永祥. 2019

作者其他论文 更多>>

微信小程序