香蕉SUS家族全基因组鉴定及生物信息学分析

文献类型： 中文期刊

第一作者： 吴建阳

作者： 吴建阳;陈妹;罗剑斌;胡会刚;武爱龙;张秀梅

作者机构：

关键词： 香蕉;蔗糖合成酶;基因家族;生物信息学

期刊名称： 热带农业科学

ISSN： 1009-2196

年卷期： 2024 年 44 卷 010 期

页码： 25-30

摘要： 蔗糖合成酶(SUS)是植物蔗糖代谢中极其重要的一种酶,既可以催化蔗糖的分解,又可以催化其合成.SUS由多基因家族编码,目前在多个物种中已分离出SUS基因家族全部成员,但香蕉中至今还没有SUS基因家族的报道.本研究利用香蕉基因组,鉴定出 5 个SUS基因,分别命名为MaSUS1~5,不均匀地分布于Chr3、Chr7、Chr8、Chr9 等4 条染色体上,其氨基酸数量为 624~844 aa,蛋白二级结构均主要由 α-螺旋和无规则卷曲组成.亚细胞定位预测分析表明,5 个SUS基因均位于细胞质中;进化树分析发现,MaSUS1 和MaSUS4 属于SUSⅡ亚家族,MaSUS2 和MaSUS5属于SUSⅢ亚家族,MaSUS3属于SUSⅠ亚家族;对其基因结构进行分析发现,外显子数量为12~15,内含子数量为11~14;对其顺式作用元件进行预测发现,光响应元件数量和种类最多,其次是激素响应元件,逆境响应元件最少.本研究可为研究调控香蕉蔗糖代谢的分子机制提供前期基础.

分类号： S668.1

  • 相关文献

[1]香蕉NINV基因家族鉴定及分析. 吴建阳,陈妹,唐路平,胡会刚,武爱龙,张秀梅. 2024

[2]玉米FLA蛋白家族的生物信息学分析. 胡颖,陈亚波,宋群星. 2017

[3]基于转录组的荔枝GRF基因家族的鉴定及表达分析. 阮城城,胡福初,王祥和,吴凤芝,周文静,吴文碟,周瑞云,陈哲. 2021

[4]辣椒紫色酸性磷酸酶基因家族的鉴定与表达特征. 程远,郭勤卫,郑佳秋,万红建. 2017

[5]大蒜WRKY基因家族的鉴定与生物信息学分析. 隋淑梅,黄思杰,田洁. 2023

[6]水稻中富含亮氨酸的重复序列和核苷酸结合位点(LRR-NBS)基因家族的生物信息学分析. 孙学辉,路铁刚,贾士荣,黄大昉. 2004

[7]棉花β-半乳糖苷酶基因家族的全基因组鉴定及分析. 曹晓聪,张朝军,苟浩琦,王小艳,乔凯凯,马启峰,张桂寅,范术丽. 2021

[8]花生AT-hook家族基因的生物信息学分析. 胡冬秀,刘浩,梁炫强,吴自明,方加海. 2021

[9]可可泛素结合酶基因家族的生物信息学初步分析. 赵秋芳,董晨,决登伟,陈宏良,贾利强. 2016

[10]甜瓜CmVDAC基因家族的鉴定及转录分析. 任凯丽,孔维萍,唐桃霞,程鸿,杨永岗,苏永全,赵晓琴. 2023

[11]基因组水平上水稻受体激酶基因家族的生物信息学分析. 孙学辉,路铁刚,贾士荣,黄大昉. 2004

[12]芫荽NPR1-like家族全基因组鉴定及分析. 王葆生,庞杰,廉勇,刘晓蕊,扈顺,刘湘萍. 2022

[13]受棉铃虫诱导的棉花糖基转移酶UGT基因家族的生物信息学及表达分析. 玛依拉·玉素音,阳妮,徐海江,杨延龙,张大伟,李春平,石必显,赖成霞. 2023

[14]苹果WRKY基因家族生物信息学及表达分析. 谷彦冰,冀志蕊,迟福梅,乔壮,徐成楠,张俊祥,董庆龙,周宗山. 2015

[15]花生紫色酸性磷酸酶基因家族的鉴定及表达分析. 杜普旋,刘浩,胡冬秀,陈小平,洪彦彬,李友国. 2022

[16]玉米KCS基因家族的生物信息学分析. 苏桂华,李春雷,于晓明,孙传波,孙志超,苏义臣. 2022

[17]马铃薯扩展蛋白基因家族的鉴定与表达分析. 理向阳,代丹丹,杨铁钢,郝西. 2017

[18]黄瓜扩展蛋白基因家族的鉴定与生物信息学分析. 郝西,理向阳,腊贵晓,代丹丹,杨铁钢. 2015

[19]小豆AUX/IAA基因家族全基因组鉴定及表达分析. 罗永坚,葛蓉,刘军,李清. 2022

[20]亚洲棉NF-YA基因家族的全基因组鉴定及表达分析. 王园园,赵春月,孙润润,秦腾飞,张金宝,郑巨云,杨秋月,翟勇全,孙家良,王清连. 2021

作者其他论文 更多>>

微信小程序