桃花花型(铃形/蔷薇形)基因型鉴定、分子标记开发与利用

文献类型： 中文期刊

第一作者： 吉爽秋

作者： 吉爽秋;王力荣;李勇;朱更瑞;曹珂;方伟超;陈昌文;王新卫;张琦;吴金龙

作者机构：

关键词： 桃;花型;全基因组关联分析（GWAS）;IGV;竞争性等位基因特异性PCR（KASP）

期刊名称： 果树学报

ISSN： 1009-9980

年卷期： 2023 年 003 期

页码： 422-431

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： 【目的】进一步完善桃花型基因型分类，开发桃花型相关分子标记，为观赏桃花的分子辅助育种提供理论支持。【方法】利用全基因组关联分析（genome-wide association study,GWAS）、IGV可视化软件分析，以及竞争性等位基因特异性PCR（Kompetitive allele-specific PCR,KASP）技术，在定位到的候选位点进行鉴定分析。【结果】GWAS定位分析在Pp08:14 518 604～14 521 291 bp存在一个ms179810转座子的缺失，x2验证结果表明，转座子的插入与缺失与花型性状无显著性关系。在转座子上游33 980 bp处鉴定到一个单碱基核苷酸（SNP）变异，变异类型分为CC型、AC型、AA型3种，比对结果显示基因型为CC型、AC型，其表型为铃形，基因型为AA型，其表型为蔷薇形，在145份桃自然群体中鉴定准确率为98.62%。但是通过表型比对发现，基因型为CC时，铃形花冠直径为（1.54±0.46）cm，同时，基因型杂合的中蟠17号自交群体后代192株中基因型与表型准确率在98.44%。【结论】根据桃基因组中Pp08:14 484 624 bp处的变异类型以及桃花型的调查结果，首次将铃形花基因型细分为纯合铃形和杂合铃形，且开发了同时鉴定纯合铃形、杂合铃形及蔷薇形的分子标记。

分类号： S662.1

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