口蹄疫病毒Hankou/99株结构蛋白的二级结构及其B淋巴细胞表位的预测

文献类型： 中文期刊

第一作者： 曾江勇

作者： 曾江勇

作者机构：

关键词： 口蹄疫病毒;结构蛋白;二级结构;抗原表位;疫苗

期刊名称： 黑龙江畜牧兽医

ISSN： 1004-7034

年卷期： 2015 年 05 期

页码： 34-38

收录情况： 北大核心

摘要： 为了获得更多抗原信息,预测猪口蹄疫病毒Hankou/99株结构蛋白的二级结构及B细胞抗原表位,试验采用DNAStar生物学软件,以Hankou/99株的基因组序列为材料,推导出相应的氨基酸序列,采用Garnier-Robson、Chou-Fasman和Karplus-Schulz方法预测蛋白质的二级结构;按KyteDoolittle、Emini及Jameson-Wolf方法分别预测蛋白质的亲水性、表面可能性以及抗原性指数,并综合分析预测此株结构蛋白的B细胞抗原表位。结果表明:此株VP1结构α-螺旋少,转角和无规卷曲多,柔性区域很丰富,VP2和VP4α-螺旋复杂,VP3含有较多的α-螺旋,但亲水性较差,出现在蛋白质表面的可能性不高。在VP1第144~147位、177~182位,VP2第132~134位和VP3第117~119位的氨基酸残基最有可能是B细胞抗原表位的优势区域。说明此株抗原位点不仅局限在VP1区,VP2和VP3也存在抗原表位。

分类号： S852.65

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