利用小RNA深度测序快速鉴定草莓病毒

文献类型： 中文期刊

第一作者： 何成勇

作者： 何成勇;高德航;范灵姣;邢飞;李世访;王红清

作者机构：

关键词： 草莓;sRNA测序;草莓白化病毒;草莓毛形病毒;RT-PCR

期刊名称： 中国农业大学学报

ISSN： 1007-4333

年卷期： 2021 年 008 期

页码： 54-60

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： 病毒侵染直接影响草莓的生长发育及果实品质,快速检测及鉴定病毒是病毒防治的前提。本研究以‘丰香’草莓和‘哈尼’草莓为试材,利用小RNA（sRNA）测序结合RT-PCR技术对2种栽培草莓品种中存在的病毒进行了研究。对sRNA测序结果进行组装和注释,结果表明:在混合样品中共有242个contigs比对到5种草莓病毒,分别为草莓白化病毒（strawberry pallidosis associated virus,SPaV）、草莓镶脉病毒（strawberry vein banding virus,SVBV）、草莓斑驳病毒（strawberry mottle virus,SMoV）、草莓毛形病毒3（strawberry crinivirus 3,SCrV 3）和草莓毛形病毒4（strawberry crinivirus 4,SCrV 4）。利用RT-PCR技术对sRNA测序结果进行验证,结果表明:SMoV、SVBV和SCrV 3在‘丰香’草莓和‘哈尼’草莓中均检测到,而SPaV和SCrV 4只在‘哈尼’草莓样品中检测到。本研究利用sRNA测序技术鉴定了2个草莓品种中存在的病毒,首次在我国生产的同一个草莓品种中检测到5种病毒,为草莓病毒的检测和防控提供了新的思路。

分类号： S436.68

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