基于高通量测序技术鉴定青花椒花叶病病原
文献类型: 中文期刊
第一作者: 邢飞
作者: 邢飞;夏思丹;戚志恩;金畑宏;淳长品
作者机构:
关键词: 高通量测序;青花椒花叶病;病毒鉴定;基因组特征;相关性分析
期刊名称: 植物保护学报
ISSN: 0577-7518
年卷期: 2025 年 52 卷 002 期
页码: 307-315
收录情况: 北大核心 ; CSCD
摘要: 为明确我国青花椒花叶病的病原及其基因组结构和分子特征,在青花椒产区调查花叶病的主要表现症状并采集病样,利用高通量测序技术鉴定病样中的病原种类,采用PCR或反转录PCR技术扩增病原基因组全长序列,并进一步对其结构、序列多样性及其与症状的相关性进行分析。结果表明:青花椒花叶病症状主要表现为叶片出现花叶、不规则的褪绿、黄化斑或带,部分感病叶片还伴随皱缩、叶缘缺刻症状;结合高通量测序结果和PCR或反转录PCR扩增序列,最终确认感花叶病样品中同时存在青花椒脉明伴随病毒(green Sichuan pepper vein clearing-associated virus,GSPVCaV)和青花椒耳突花叶病毒(green Sichuan pepper enamovirus,GSPEV),并克隆获得GSPVCaV-DJ分离物基因组,全长为8 099 nt,包含3个开放阅读框,属于杆状DNA病毒属Badnavirus的典型结构特征;序列比对发现GSPVCaV-DJ分离物与其余8条GSPVCaV分离物基因组的核苷酸序列一致性为97.2%~98.8%,相似性较高;在田间采集的感花叶病样品中均检出了GSPVCaV,无明显症状样品中则未检出该病毒,说明GSPVCaV与青花椒花叶病症状有较高的相关性,而GSPEV在这2种症状样品中均有检出,检出率达90%,表明GSPVCaV是引起我国青花椒花叶病的主要病原。
分类号: S435.73
- 相关文献
[1]苹果茎痘病毒在山楂中的首次鉴定与序列分析. 高德航,何成勇,邢飞,侯婉莹,李世访,战斌慧,王红清. 2021
[2]老面对面团发酵过程中菌群结构及风味物质的影响. 刘悦,张灿,高玲玲,张康逸,闫美慧,张国治. 2022
[3]芋[Colocasiaesculenta(L.) Schott]的倍性水平及基因组特征解析. 殷剑美,王立,蒋璐,韩晓勇,郭文琦,李春宏,张培通. 2019
[4]一株猪源化脓隐秘杆菌的鉴定、生物学特性研究与基因组分析. 谭佳,曾艳兵,李海琴,张帆帆,杨群,方绍培,季华员,谭美芳. 2021
[5]鸡腺病毒血清8a型毒株的分离鉴定及致病特点. 李慧昕,宋文平,韩宗玺,刘胜旺. 2023
[6]鳀科鱼类线粒体全基因组序列结构特征及系统发育信息分析. 张丽丽,程起群. 2012
[7]Asia1型口蹄疫病毒YNBS/58株基因组特征及其表达研究. 独军政,常惠芸,丛国正,林彤,邵军军,沈小燕,才学鹏,谢庆阁. 2006
[8]玉米Suwan种质改良过程中的关键基因组区段发掘. 李秀诗,吴迅,吴文强,刘鹏飞,郭向阳,王安贵,祝云芳,陈泽辉. 2019
[9]两株不同疾病型鸭呼肠孤病毒部分生物学特性的比较. 陈仕龙. 2013
[10]川芎基因组survey测序及其特征分析. 毛常清,沙秀芬,黄静,陶珊,彭芳,李群,张超,袁灿. 2023
[11]侵染假酸浆的泰国番茄黄化曲叶病毒全基因组结构特征. 张水英,赵丽玲,钟静,李婷婷,丁铭. 2023
[12]柑桔黄脉病研究进展. 李文婷,陈克玲,何建,何礼,关斌,张国艳,刘建军. 2024
[13]一株多谱系重组NADC34-like-PRRSV的分离鉴定及其基因组特征分析. 张兴民,张婧,虞凌雪,王健,王方洲,李娇阳,李国秀,李冬,马雪青,白兴文,龚真莉,卢曾军,曾巧英,孙普. 2024
[14]利用小RNA深度测序技术鉴定上海地区'红美人'柑橘病毒种类. 张丽勍,管丽琴,蒋飞,方献平,李水根,张学英. 2021
[15]基于小RNA深度测序和RT-PCR检测侵染广东省冬种马铃薯的病毒. 路秉翰,汤亚飞,于琳,佘小漫,邓铭光,何自福. 2019
[16]新疆甜菜花叶病发生和病原病毒的研究. 向本春,席德慧,刘升学,曾幼玲,谢浩. 2000
[17]山羊痘病毒的鉴定及序列分析. 张克山,郑海学,靳野,何继军,刘永杰,尚佑军,郭建宏,卢国栋,田宏,刘湘涛. 2011
[18]上海崇明水仙病毒病病原种类鉴定. 梁艳,宋荣浩,杨翠云,陆金萍,蒋军喜,戴富明. 2008
[19]广西西瓜花叶病病原病毒鉴定. 蔡健和,刘志明,余玉冰. 2001
[20]Small RNA深度测序鉴定甘薯种质的甘薯曲叶病毒. 张道微,董芳,张超凡,邹学校. 2019
作者其他论文 更多>>
-
四川眉山柑橘叶片营养元素含量特征与评价
作者:戚志恩;邢飞;龙勇;朱礼乾;袁梦;李永安;徐海涛;席利娟;淳长品;王寿先
关键词:柑橘;叶片;矿质营养元素;分布特征;综合营养指数;眉山市
-
脆李叶片营养元素丰缺分级标准的初步研究
作者:邢飞;黄源;杨传祥;凌丽俐;王男麒;戚志恩;孔文斌;淳长品;王寿先
关键词:脆李;叶片;标准研究;营养诊断;分布规律
-
基于YOLO v5-MNv4S与RANSAC-GN的柑橘姿态估计方法
作者:李丽;张官明;张云峰;梁继元;淳长品
关键词:柑橘采摘;目标检测;姿态估计;轻量化网络;点云处理;MobileNetV4
-
柑橘裂皮类病毒(CEVd)的种群结构及遗传变异分析
作者:夏凯峰;戚志恩;夏思丹;邢飞
关键词:柑橘;CEVd;基因组;种群结构;遗传变异
-
柑橘裂果的成因与防治措施探讨
作者:余靖;李梦;曹立;凌丽俐;彭良志;淳长品;付行政
关键词:柑橘;裂果;果皮结构;防治措施
-
基于改进YOLO v5的复杂环境下柑橘目标精准检测与定位方法
作者:李丽;梁继元;张云峰;张官明;淳长品
关键词:柑橘采摘机器人;目标检测;状态区分;三维坐标获取;复杂环境;YOLO v5
-
苹果坏死花叶病毒CP基因原核表达及其抗血清制备
作者:邢飞;王红清;李世访
关键词:苹果坏死花叶病毒;外壳蛋白基因;原核表达;抗血清;酶联免疫吸附分析方法
