基于高通量测序技术鉴定青花椒花叶病病原

文献类型: 中文期刊

第一作者: 邢飞

作者: 邢飞;夏思丹;戚志恩;金畑宏;淳长品

作者机构:

关键词: 高通量测序;青花椒花叶病;病毒鉴定;基因组特征;相关性分析

期刊名称: 植物保护学报

ISSN: 0577-7518

年卷期: 2025 年 52 卷 002 期

页码: 307-315

收录情况: 北大核心 ; CSCD

摘要: 为明确我国青花椒花叶病的病原及其基因组结构和分子特征,在青花椒产区调查花叶病的主要表现症状并采集病样,利用高通量测序技术鉴定病样中的病原种类,采用PCR或反转录PCR技术扩增病原基因组全长序列,并进一步对其结构、序列多样性及其与症状的相关性进行分析。结果表明:青花椒花叶病症状主要表现为叶片出现花叶、不规则的褪绿、黄化斑或带,部分感病叶片还伴随皱缩、叶缘缺刻症状;结合高通量测序结果和PCR或反转录PCR扩增序列,最终确认感花叶病样品中同时存在青花椒脉明伴随病毒(green Sichuan pepper vein clearing-associated virus,GSPVCaV)和青花椒耳突花叶病毒(green Sichuan pepper enamovirus,GSPEV),并克隆获得GSPVCaV-DJ分离物基因组,全长为8 099 nt,包含3个开放阅读框,属于杆状DNA病毒属Badnavirus的典型结构特征;序列比对发现GSPVCaV-DJ分离物与其余8条GSPVCaV分离物基因组的核苷酸序列一致性为97.2%~98.8%,相似性较高;在田间采集的感花叶病样品中均检出了GSPVCaV,无明显症状样品中则未检出该病毒,说明GSPVCaV与青花椒花叶病症状有较高的相关性,而GSPEV在这2种症状样品中均有检出,检出率达90%,表明GSPVCaV是引起我国青花椒花叶病的主要病原。

分类号: S435.73

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