水牛STAT基因家族分析

文献类型： 中文期刊

第一作者： 梁莎莎

作者： 梁莎莎;庞春英;邓廷贤;陆杏蓉;段安琴;马小娅;方艳艳;梁贤威

作者机构：

关键词： 水牛;STAT;基因结构;共线性;系统发育;表达量

期刊名称： 中国牛业科学

ISSN： 1001-9111

年卷期： 2022 年 001 期

页码： 45-52

摘要： 试验通过生物信息学技术对信号转导和转录激活子（signal transducer and activators of transcription,STATs）基因家族进行了motif、基因结构分析、共线性分析、不同物种系统进化分析和表达量分析，旨在挖掘水牛STAT基因家族的功能。结果表明，水牛STAT基因家族共有7个家族成员并分别命名为bbu.STAT1～6,其中bbu.STAT5分为bbu.STAT5A和bbu.STAT5B。bbu.STAT1和bbu.STAT4位于2号染色体，bbu.STAT2和bbu.STAT6位于4号染色体，bbu.STAT3、bbu.STAT5A和bbu.STAT5B位于3号染色体。这7个STAT蛋白长度在748～865 aa之间，等电点PI均小于7,说明水牛STAT蛋白均属于酸性蛋白质。基因结构分析发现不同的组具有不同的内含子数模式。Motif分析发现，除bbu.STAT2外，均含有预测出的motif 1～10且排序相同，说明水牛STAT基因家族成员蛋白功能相似。共线性分析结果显示，水牛和奶牛中均存在3对相同成员的STAT基因表现出串联重复且没有发现片段重复，推测串联复制在水牛和奶牛STAT家族的扩增中起着主导作用。发现2个水牛STAT基因对的Ka/Ks值小于0.5,且STAT5A-STAT5B小于0.1,说明该基因对具有更强的纯化选择压力。不同物种STAT系统发育分析显示，STAT基因家族具有较高的保守性，其中水牛与奶牛和牦牛的聚类更为相近。表达量分析发现所有STAT基因在乳腺组织中均有表达，其中STAT5A的表达量最高，STAT4的表达量最低，推测水牛STAT基因家族参与调控乳房发育及泌乳过程，其中STAT5A可能起更重要的作用。

分类号： S823.83

  • 相关文献

[1]鲤sPLA_2-Ⅲ基因结构、系统发育和表达特征. 许迪辉,李红霞,李建林,唐永凯,王钦,张磊,沈泽恩,俞菊华. 2019

[2]副黏病毒V蛋白阻断干扰素信号通路的分子机制研究进展. 傅强,仇旭升,陈素娟,彭大新,丁铲. 2013

[3]禾谷类物作的比较基因组研究. 郑康乐. 1996

[4]建鲤生长性状QTL区间及其与镜鲤同源性比对. 顾颖,鲁翠云,张晓峰,李超,俞菊华,孙效文. 2013

[5]玉米OFP基因家族全基因组鉴定及表达分析. 张彦琴,常建忠,董春林,杨丽莉,张正,杨睿,梁改梅,丁保朋. 2020

[6]三倍化复制对白菜花粉特异表达候选基因的影响. 王晓波,马原,程锋,武剑,梁建丽,王晓武. 2015

[7]普通烟草热激转录因子家族的全基因组鉴定与分析. 郭存,王奇,李晓旭,张震彪,文利超,邓智超,初雨蒙,刘涛,崔萌萌,郭永峰. 2022

[8]作物肥料效应函数模型研究进展与展望. 章明清,李娟,孔庆波,严芳. 2016

[9]白菜硫代葡萄糖甙合成中MAM的进化分析. 刘锦,张冀芳,梁建丽,程锋,武剑,王晓武. 2014

[10]西瓜抗病毒基因zym-CH的比较图谱定位. 徐向丽,郭绍贵,宫国义,许勇,卢向阳,彭振兴,张海英. 2009

[11]大白猪SLA-DR基因的表达规律研究. 张冬杰,杨国伟,刘娣. 2008

[12]草原红牛不同组织雄激素受体基因表达量检测及比较研究. 秦立红,刘伟英,张丽颖,张金玉,张国梁,赵玉民,张嘉保,赵志辉. 2010

[13]FASN基因与牦牛肌内脂肪酸组成的相关性研究. 秦文,吴晓云,李天科,阎萍. 2014

[14]新疆小麦高分子量麦谷蛋白亚基表达量及其与品质性状相关性研究. 曹俊梅,张新忠,范贵强,芦静,吴新元,周安定,刘联正,聂石辉. 2020

[15]棉花FT基因的特征和表达分析. 刘春艳,刘春艳,刘杰,陈伟,朱守鸿,李燕,曹新川,何良荣,张永山. 2021

[16]高温胁迫下B型烟粉虱热激蛋白基因hsp70表达量的变化. 谢明,万方浩. 2007

[17]抗生素利福平对Q烟粉虱防御基因表达水平的影响. 刘凌云,苏奇,方艺伟,张友军,褚栋. 2015

[18]小菜蛾中肠氨肽酶N3基因片断克隆技巧及其表达量. 常晓丽,吴青君,王少丽,徐宝云,张友军. 2011

[19]小麦Glu-1位点变异和1B/1R易位对谷蛋白亚基表达量和面包加工品质的影响. 唐建卫,刘建军,张平平,肖永贵,张勇,曲延英,何中虎. 2008

[20]柑橘CsNCED3-2的克隆及其响应溃疡病菌侵染的表达分析. 谢宇,张庆雯,祁静静,邹修平,何永睿,许兰珍,雷天刚,彭爱红,李强,姚利晓,陈善春,龙琴. 2020

作者其他论文 更多>>

微信小程序