水牛MFSD2A基因CDS序列克隆及生物信息学分析

文献类型： 中文期刊

第一作者： 梁莎莎

作者： 梁莎莎;于农淇;鄢胜飞;黄荣春;潘伟军;李厅厅;卢瑛;黄健;谭正准;覃广胜

作者机构：

关键词： 水牛;主要促进因子超家族成员2a(MFSD2A);基因克隆;生物信息学

期刊名称： 中国牛业科学

ISSN： 1001-9111

年卷期： 2025 年 51 卷 003 期

页码： 11-19

摘要： 运用生物信息学方法，对水牛主要促进因子超家族成员2a（major facilitator superfamily domain containing 2a,MFSD2A）基因编码序列进行克隆及分析。以水牛MFSD2A预测基因序列（GenBank登录号：XM＿006061915.4）为模板，克隆了水牛MFSD2A基因完整CDS序列，全长1 572 bp,可编码523个氨基酸残基；分子式为C2 669H4 150N652O725S23,分子质量57.71 ku,半衰期30 h,消光系数71 445,脂肪系数105.56,理论等电点（PI）8.2,不稳定系数为34.78,总平均亲水性为0.462,说明水牛MFSD2A属于碱性稳定疏水蛋白质；二级和三级结构分析结果显示，水牛MFSD2A蛋白主要由α-螺旋、β-折叠、衍生片段和无规则卷曲组成，其中α-螺旋占46.65%,β-折叠占4.59%,衍生片段占16.25%,无规则卷曲占32.5%;亚细胞定位结果显示，水牛MFSD2A定位于细胞质膜、内质网、细胞核和线粒体的比例分别为60.9%、30.4%、4.3%和4.4%,说明水牛MFSD2A主要分布于细胞质膜中；跨膜结构和信号肽预测分析表明，该蛋白存在10个跨膜域，不存在信号肽，故此蛋白属于跨膜蛋白，不属于分泌蛋白；磷酸化位点预测结果显示，水牛MFSD2A蛋白共有48个磷酸化位点，其中丝氨酸磷酸化位点22个，苏氨酸磷酸化位点21个，酪氨酸磷酸化位点5个；糖基化位点预测结果显示，水牛MFSD2A蛋白存在1个潜在的N-糖基化位点和77个O-糖基化位点；同源性分析结果表明，水牛MFSD2A的氨基酸序列与黄牛、山羊、猪、骆驼、家犬和人的同源相似性分别为98.7%、98.5%、94.0%、93.5%、91.0%和87.0%,说明MFSD2A具有较高的保守性。

分类号： S823.83

  • 相关文献

[1]水牛溶血磷脂酸受体3基因的克隆及生物信息学分析. 庞春英,梁莎莎,马小娅,邓廷贤,陆杏蓉,段安琴,黄韵琪,梁贤威. 2018

[2]水牛甲状旁腺素基因克隆与生物信息学分析. 梁莎莎,马小娅,邓廷贤,陆杏蓉,段安琴,朱鹏,梁贤威,庞春英. 2017

[3]水牛PTHLH基因克隆分析及其真核表达载体构建. 陆杏蓉,梁莎莎,邓廷贤,段安琴,马小娅,庞春英,梁贤威. 2018

[4]水牛ABCD基因家族生物信息学分析及ABCD1基因表达研究. 马小娅,梁燕银,陆杏蓉,段安琴,梁莎莎,邓廷贤. 2021

[5]水牛PTHLH基因克隆分析及其真核表达载体构建. 陆杏蓉,梁莎莎,邓廷贤,段安琴,马小娅,庞春英,梁贤威. 2018

[6]河流型水牛LPL基因在不同组织及泌乳期的表达水平分析. 梁莎莎,庞春英,邓廷贤,陆杏蓉,段安琴,马小娅,梁贤威. 2022

[7]奶水牛固醇携带蛋白2基因克隆、生物信息学分析及其组织表达检测. 梁莎莎,庞春英,邓廷贤,马小娅,陆杏蓉,段安琴,梁贤威. 2018

[8]甘蓝型油菜GPAT9基因克隆与生物信息学分析. 刘少锋,邬贤梦,官春云,熊兴华. 2016

[9]中华蜜蜂气味结合蛋白基因AcerOBP14的克隆及时空表达. 杜亚丽,张中印,潘建芳,王树杰,杨爽,赵慧婷,姜玉锁. 2016

[10]无芒隐子草SAMS1基因的克隆及干旱胁迫下的表达分析. 孔令芳,张吉宇,刘志鹏,王彦荣. 2013

[11]中华蜜蜂GABARAP基因克隆、生物信息学分析及原核表达载体的构建. 于慧敏,吴鹏杰,李南南,谭静,徐书法,武江利. 2022

[12]小麦逆境胁迫相关基因TaCBL7的克隆、生物信息学及表达特性分析. 龙翔宇,蒲至恩,郑科,刘泽厚. 2013

[13]无芒隐子草CsPEAMT基因克隆及表达特性分析. 段珍,张吉宇,狄红艳,霍雅馨. 2014

[14]烟草NtMYB44b转录因子基因克隆以及生物信息学和表达分析. 余婧,郭玉双,雷波,张孝廉,赵德刚. 2020

[15]铁棍山药SUS基因CDS区克隆与生物信息学分析. 刘苏伟,文艺,张骆琪,高素霞,刘玉霞,王飞,鲁传涛,刘红彦. 2019

[16]野巴旦杏AlsCBF基因的克隆及生物信息学分析. 李宁,李疆,刘立强,罗淑萍. 2015

[17]中间锦鸡儿WRKY12基因克隆与生物信息学分析. 万东莉,张杰,王瑞刚,李国婧,万永青. 2020

[18]大刍草SAMS1基因克隆与生物信息学分析. 张玉荣,杨雅舒,申圣圣,王陆军,郭虹霞,邓妍,王创云,杨利艳. 2020

[19]大豆胞囊线虫病抗性候选基因GmPEBP4-1克隆及表达分析. 郭杨,陈立新,姜海鹏,战宇航. 2020

[20]小麦胁迫相关基因TaSF3B2的克隆及表达特性分析. 黄鑫,夏百成,龙翔宇. 2016

作者其他论文 更多>>

微信小程序