杜梨2个MYB转录因子基因的克隆及序列分析

文献类型： 中文期刊

第一作者： 冉昆

作者： 冉昆;王少敏;董放;魏树伟;张勇;王宏伟

作者机构：

关键词： 杜梨;MYB转录因子;基因克隆;序列分析

期刊名称： 果树学报

ISSN： 1009-9980

年卷期： 2016 年 S1 期

页码： 52-58

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： 【目的】克隆杜梨(Pyrus betulifolia Bunge)MYB家族的2个基因(Pb3RMYB和Pb4RMYB),分析其序列特征,为研究其调控的分子机制奠定基础。【方法】利用RT-PCR和RACE技术克隆杜梨Pb3RMYB和Pb4RMYB的c DNA序列全长;利用BLAST和ORF Finder对核酸序列进行分析,利用CDD、Prot Param、TMHMM、Signal P、Plant-m Ploc、SPOMA、DANMAN、MEGA6等软件对氨基酸序列进行分析。【结果】克隆得到Pb3RMYB和Pb4RMYB基因全长,Gen Bank登录号分别为KX272614和KX272615。2者均含有MYB保守结构域,二级结构均以无规则卷曲、α-螺旋、延伸链和β-折叠为主,亚细胞定位分析表明2者均定位于细胞核中。其中,Pb3RMYB属于3R-MYB亚家族,全长2 355 bp,ORF长1 710bp,编码569个氨基酸,蛋白分子质量约为62 077.3 Da,等电点为7.08;BLAST分析表明Pb3RMYB与已报道的其他物种3RMYB具有较高的相似度。Pb4RMYB属于4R-MYB亚家族,全长3 625 bp,ORF长2 913 bp,编码970个氨基酸,蛋白分子质量约为109 600.6 Da,等电点为7.41。【结论】获得了2个杜梨MYB基因Pb3RMYB和Pb4RMYB,分别属于3RMYB和4R-MYB亚家族。

分类号： S661.2

  • 相关文献

[1]杜梨CPI基因的克隆、序列分析及表达. 李慧,丛郁,常有宏,蔺经,盛宝龙. 2011

[2]基于转录组信息的杜梨盐胁迫相关MYB转录因子鉴定与分析. 李慧,张雨峰,李晓刚,王中华,常有宏,蔺经. 2024

[3]杜梨甜菜碱醛脱氢酶基因的克隆及非生物胁迫下的转录反应. 李慧,丛郁,常有宏,蔺经,盛宝龙. 2012

[4]杜梨类钙调磷酸酶B亚基蛋白基因PbCBL2的克隆和功能初探. 李慧,李刚波,丛郁,常有宏,蔺经,盛宝龙. 2013

[5]杜梨类钙调磷酸酶B亚基蛋白PbCBL10基因的克隆和表达特性研究. 李慧,丛郁,常有宏,蔺经,盛宝龙. 2012

[6]杜梨PbPEAMT的克隆、序列分析及表达特征. 李慧,丛郁,常有宏,蔺经,盛宝龙. 2012

[7]杜梨胆碱单加氧酶基因克隆及胁迫表达. 李慧,丛郁,常有宏,蔺经,盛宝龙. 2012

[8]耐盐杜梨蛋白磷酸酶基因PbPP2C的克隆及表达分析. 王宏,蔺经,李晓刚,杨青松,常有宏. 2014

[9]盐胁迫下的杜梨PbPYL4基因克隆及其与PbNCED2基因表达分析. 王宏,蔺经,李晓刚,王中华,常有宏. 2014

[10]杜梨类钙调磷酸酶B亚基蛋白PbCBLIO基因的克隆和表达特性研究. 李慧,丛郁,常有宏,蔺经,盛宝龙. 2012

[11]杜梨响应盐胁迫CIPK01的克隆及表达分析. 王影,李慧,蔺经,杨青松,常有宏. 2019

[12]茶树2个MYB转录因子基因的克隆及表达分析. 马春雷,姚明哲,王新超,金基强,陈亮. 2012

[13]棉花转录因子基因(GhMYB11)的克隆与表达分析. 李菲,柳展基,王立国,刘勤红,刘任重. 2015

[14]小麦转录因子TaMyb2s的克隆及表达. 贾东升,毛新国,景蕊莲,张晓科,昌小平. 2008

[15]甘蓝胞质雄性不育(OguCMS)相关的MYB转录因子BoMYB1的克隆与表达分析. 张磊,康宗利,刘海霞,康俊根. 2012

[16]多花水仙WRKY转录因子的克隆与序列分析. 李欢,何炎森,李科,申艳红,吴用,陈晓静. 2014

[17]小麦锌指蛋白基因的克隆、序列与表达分析(英文). 万平,令利军,周文娟,张文俊,凌宏清,朱立煌,张相岐. 2004

[18]中国对虾血蓝蛋白基因cDNA的克隆与序列分析. 孙杰,王宝杰,孙姝娟,李晓华,姜珊,刘梅,蒋克勇,王雷. 2010

[19]紫色甘薯渝紫薯7号黄烷酮3-羟化酶基因的克隆和序列分析. 黄元射,舒田,毛景欣,陈敏. 2016

[20]烟夜蛾感觉神经元膜蛋白基因的克隆、序列分析与组织特异性表达. 罗梅浩,蔡永萍,赵艳艳,王甜甜,郭线茹,原国辉. 2012

作者其他论文 更多>>

微信小程序