基于木薯全基因组重测序的InDel标记开发及应用

文献类型： 中文期刊

第一作者： 陆佳毓

作者： 陆佳毓;王明;肖鑫辉;李开绵;张洁;薛茂富;符乃方;万仲卿;王颜

作者机构：

关键词： 木薯(Manihot esculenta Crantz);InDel标记;基因组重测序;遗传多样性分析

期刊名称： 分子植物育种

ISSN： 1672-416X

年卷期： 2024 年 22 卷 010 期

页码： 3224-3235

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： 本研究旨在开发稳定可靠、操作简便的木薯InDel分子标记,为木薯种质资源遗传多样性研究、品种鉴定等工作提供有力工具,为木薯育种发展提供保障.本研究基于22份木薯种质资源全基因组重测序分析结果随机挑选了 64个InDel分子标记进行引物设计并利用琼脂糖凝胶电泳检测进行有效性验证,结果有20对引物具有多态性,多态性率为31.25%.随后将具有多态性的且扩增效果最优的18个InDel标记扩增条带数进行统计生成矩阵用于木薯种质资源遗传多样性研究,各标记的基因多样性指数于0.21~0.50之间,香农多样性指数于0.36~0.70之间.聚类结果分析将72份木薯材料在遗传相似系数0.62处划分为2大类群.且将中国的地方品种及选育品种大多划分至1#中的同一分支,其余薯肉颜色及内皮颜色相同的木薯材料大多都聚类到了一起.此外,本研究开发出的InDel分子标记IDC46具有特异性,可用于特定木薯材料鉴定.说明后期InDel引物有望成为木薯指纹图谱及分子身份证构建的有效工具,本研究结果也将对木薯育种工作后续开展具有一定的参考意义.

分类号： S533

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