SiASRs家族基因的鉴定及表达分析
文献类型: 中文期刊
第一作者: 宋健
作者: 宋健;曹晓宁;王海岗;陈凌;王君杰;刘思辰;乔治军
作者机构:
关键词: 谷子;ASR;家族基因;生物信息学;表达分析
期刊名称: 作物杂志
ISSN: 1001-7283
年卷期: 2019 年 06 期
页码: 33-42
收录情况: 北大核心
摘要: ASR蛋白是植物特有的一类蛋白,是参与并提高植物抗旱性和耐盐性过程中非常重要的蛋白之一。利用生物信息学方法,对8个谷子SiASRs家族基因编码的蛋白进行理化性质的分析、启动子的分析和系统进化树构建等,并结合qRT-PCR进行10%PEG-6000和150mmol/L NaCl胁迫下的表达分析。结果表明,谷子SiASRs家族的8个基因编码的蛋白都包含典型的ABA/WDS结构,该基因家族编码的蛋白质都不具有信号肽。系统发育树分析结果表明,在遗传进化上谷子与柳枝稷亲缘关系较近,与双子叶的番茄和大豆ASR蛋白的亲缘关系较远。PEG胁迫下基因的表达分析显示,8个SiASRs基因在受到PEG胁迫诱导后在根、茎、叶中表达量差异显著。NaCl胁迫下基因的表达分析结果显示,8个ASR基因对NaCl胁迫的响应主要在叶中体现,整体呈上调表达趋势;8个ASR基因在茎中表达变化较为稳定;在根部主要由ASR1、ASR2、ASR4、ASR5、ASR6参与NaCl胁迫响应,均为上调表达。
分类号: S515
- 相关文献
[1]香蕉ASR的特征和采后表达分析. 贾彩红,徐碧玉,刘菊华,张建斌,冯仁军,金志强. 2014
[2]玉米SPP基因家族的全基因组鉴定及表达分析. 何冰,时丕彪,吕远大,陈国祥. 2019
[3]甘蓝型油菜PIN家族基因的鉴定与生物信息学分析. 高堃,华营鹏,宋海星,官春云,张振华,周婷. 2018
[4]谷子HSP70基因家族的全基因组鉴定及生物信息学分析. 张古文,刘莉莉,王显瑞,柴晓娇,李书田. 2015
[5]谷子NCED基因家族鉴定及其干旱胁迫响应表达模式分析. 程鸿燕,郭昱,马芳芳,王玉文,禾璐,韩渊怀. 2019
[6]谷子COBRA家族成员的全基因组鉴定及表达模式分析. 任昂彦,陈环宇,王根平,施洋,陆镇威,陈涛,李晓莎,潘宗瑾,戚永奎,杨华. 2024
[7]谷子
[8]牵牛E3泛素连接酶PNRma1基因的克隆及抗旱相关性分析. 代锦绣,董轩名,倪欢欢,董延龙,金晓霞. 2017
[9]miR-18a-5p在鸡不同生长时期的表达及其生物信息学分析与靶基因预测. 黄正洋,黄华云,穆春宇,李春苗,王钱保,黎寿丰,赵振华. 2021
[10]基于转录组的荔枝GRF基因家族的鉴定及表达分析. 阮城城,胡福初,王祥和,吴凤芝,周文静,吴文碟,周瑞云,陈哲. 2021
[11]大白菜TPS基因家族鉴定及其在高温胁迫下的表达分析. 庞强强,蔡兴来,孙晓东,张文,周曼. 2020
[12]烟草NtMYB44b转录因子基因克隆以及生物信息学和表达分析. 余婧,郭玉双,雷波,张孝廉,赵德刚. 2020
[13]大豆GmGLRs基因全基因组鉴定与表达分析. 崔晓霞,赵硕,郭书巧,束红梅,何晓兰,倪万潮,巩元勇,刘来华. 2019
[14]板栗PPO基因克隆及生物信息学分析. 程丽莉,程运河,兰彦平,曹庆昌,胡广隆,苏淑钗. 2020
[15]罗汉果3-羟基-3-甲基戊二酰辅酶A还原酶基因的克隆及表达分析. 荆礼,赵欢,莫长明,苏航,唐秋竹,张鹤. 2020
[16]芒果中性/碱性转化酶MiNI基因的克隆与表达分析. 郭利军,邓会栋,冯学杰,罗志文,陈哲,范鸿雁,胡福初,华敏. 2020
[17]番茄WRKY转录因子in silico鉴定及表达分析. 万红建,俞锞,袁伟,刘云飞,叶青静,王荣青,阮美颖,姚祝平,杨悦俭. 2013
[18]大豆胞囊线虫病抗性候选基因GmPEBP4-1克隆及表达分析. 郭杨,陈立新,姜海鹏,战宇航. 2020
[19]蓖麻GRF转录因子家族生物信息学鉴定及表达分析. 代梦媛,高梅,李文昌. 2021
[20]辣椒紫色酸性磷酸酶基因家族的鉴定与表达特征. 程远,郭勤卫,郑佳秋,万红建. 2017
作者其他论文 更多>>
-
新时期农业科研院所科研档案管理提升对策研究-以河北省农林科学院为例
作者:李欣明;韩轩;张新仕;宋健
关键词:农业科研院所;科研档案;档案管理;河北省农林科学院
-
抗菌肽在毕赤酵母中表达的研究进展
作者:查曼;闵勇;刘晓艳;朱镭;邱一敏;陈凌;周荣华;王常高
关键词:抗菌肽;抗生素;微生物耐药性;毕赤酵母;重组表达
-
内蒙古糜黍资源DNA分子身份证的构建
作者:冯智尊;辛旭霞;曹越;郭娟;王晓丹;曹晓宁;Santra Dipak K;陈凌;乔治军;王瑞云
关键词:糜黍;内蒙古;荧光SSR标记;毛细管电泳;分子身份证
-
连作及间作黄芩对核桃苗生长及土壤化学性质的影响
作者:谢佳怡;韦长江;徐海根;宋健;齐建勋;张赟齐;翟长远;侯智霞
关键词:核桃;连作障碍;黄芩;间作;矿质营养;土壤化学性质
-
5个黍子育成品种耐盐性鉴定
作者:郭娟;王昕;曹晓宁;陈凌;Santra Dipak K;王瑞云;乔治军
关键词:黍子;育成品种;耐盐性;农艺性状
-
为害北苍术根螨的种类鉴定与防治初探
作者:王萌红;程佳旭;梁欣;郭雪涛;丰硕;曹伟平;贾海民;刘廷辉;宋健
关键词:北苍术;根螨;种类鉴定;分子标记;罗宾根螨
-
糜子SBP基因家族全基因组鉴定及表达分析
作者:段政勇;丁敏;王宇卓;丁艺冰;陈凌;王瑞云;乔治军
关键词:糜子;SBP基因;全基因组鉴定;基因表达分析
