山羊副流感病毒3型感染MDBK细胞的miRNA表达谱变化分析

文献类型： 中文期刊

第一作者： 李基棕

作者： 李基棕;李文良;毛立;郝飞;杨蕾蕾;张纹纹;江杰元

作者机构：

关键词： 山羊副流感病毒3型;miRNA;MDBK细胞;高通量测序

期刊名称： 畜牧兽医学报

ISSN： 0366-6964

年卷期： 2017 年 48 卷 05 期

页码： 896-906

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： 本研究旨在分析山羊副流感病毒3型(CPIV3)感染MDBK细胞和正常MDBK细胞差异表达的miRNA,以探索miRNA在CPIV3感染过程中的作用及其调控机制。将CPIV3感染MDBK细胞,利用高通量测序技术检测分析MDBK细胞中miRNA表达谱,并筛选差异表达的miRNA。对靶基因进行GO注释和KEGG富集。结果显示,有37个miRNA显著差异表达(P<0.001),其中18个miRNA在病毒感染中上调,19个miRNA在病毒感染中下调。经RT-qPCR方法验证5个差异表达的候选miRNA,结果与高通量测序分析有很好的一致性。进一步GO功能注释表明:差异表达的miRNA靶基因生物学功能相对集中在免疫调节、细胞生物调控及细胞新陈代谢等生物过程。这些靶基因参与多种细胞的信号通路,包括细胞黏附分子、B细胞受体信号通路、MAPK信号通路、代谢通路、黏合斑、钙离子信号通路和趋化因子信号通路等。本研究为进一步探讨CPIV3致病机制奠定了基础。

分类号： S852.659.5

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