水稻显性半矮秆基因的SCAR标记及初步定位

文献类型： 中文期刊

第一作者： 刘斌美

作者： 刘斌美;吴跃进;童继平;吴敬德;余增亮;张瑛;程灿

作者机构：

关键词： 水稻;半矮秆突变体;显性基因;SCAR;基因定位

期刊名称： 作物学报

ISSN： 0496-3490

年卷期： 2006 年 32 卷 03 期

页码： 449-454

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： 粳稻品系Y98149是从离子束诱变的后代中获得的显性半矮秆突变体,与野生型Y98148是1对株高近等基因系。将已经获得的3个与水稻显性半矮秆基因紧密连锁的RAPD标记分别克隆、测序,根据测序结果设计了3对特异性PCR引物,成功地将RAPD标记S1041525、S1076549和S1272403转化成更稳定的SCAR标记SCS1041498、SCS1076510和SCS1272388。通过Y98148×Y98149的F2代分离群体的分析,这3个SCAR标记与显性半矮秆基因的遗传距离分别为12.6cM、7.5 cM和16.3 cM,且位于基因的同一侧。序列同源性比较表明,标记S1272403为单拷贝,其核苷酸序列与水稻第7染色体上2个BAC克隆B1249D05(AP006451)和OJ1212-C12(AP005604)同源性为99%,B1249D05与OJ1212-C12有23 kb的重叠区域,标记S1272403位于这个重叠区域,据此初步将显性半矮秆基因定位,为进一步精确定位和图位克隆奠定了基础。

分类号： S511

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