香蕉长链非编码RNA Malnc2310启动子区域分析及上游调控因子筛选

文献类型： 中文期刊

第一作者： 李文彬

作者： 李文彬;于晓玲;闫羿辰;孙建波

作者机构：

关键词： 香蕉;Malnc2310;启动子;顺式作用元件;调控因子

期刊名称： 南京农业大学学报

ISSN： 1000-2030

年卷期： 2023 年 46 卷 002 期

页码： 287-296

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： [目的]为了深入研究香蕉长链非编码RNA Malnc2310 的功能和特性,对Malnc2310 的启动子顺式作用元件、病原菌响应模式及结合因子进行了初步的研究.[方法]将Malnc2310 全长启动子P1(1625 bp)及从 5′端到 3′端序列互补的启动子片段P2(400 bp)、P3(800 bp)和P4(425 bp)转入拟南芥,研究其在高盐和尖孢镰刀菌粗毒素胁迫下的响应模式;以Malnc2310 启动子P1 为诱饵,利用酵母单杂交技术筛选获得与该启动子结合的转录因子,并确定启动子的核心功能区.[结果]Malnc2310 的启动子包含多个与光照、病原菌、激素响应相关的顺式作用元件;所有启动子片段在尖孢镰刀菌粗毒素处理的GUS活性比高盐处理后更高,且P3 驱动下GUS的活性与全长P1 驱动下的活性相似;通过酵母单杂文库筛选到128个潜在的结合因子序列,其中双C2H2结构的锌指蛋白ZFP-WIP2经点对点酵母单杂交验证可与P1和P3互相结合.[结论]Malnc2310 的启动子对尖孢镰刀菌粗毒素比对高盐处理更敏感,筛选到 1 个锌指蛋白ZFP-WIP2 可与启动子核心功能区(425~1225 bp)结合.

分类号： S668.1%Q943.2

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