利用Solexa测序技术发掘木薯microRNAs

文献类型： 中文期刊

第一作者： 张何芳

作者： 张何芳;陈新;卢诚;章伟雄;王文泉

作者机构：

关键词： 木薯;miRNA;Solexa测序

期刊名称： 中国农学通报

ISSN： 1000-6850

年卷期： 2012 年 28 卷 30 期

页码： 184-190

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： 为了发掘木薯中的microRNAs(miRNAs),了解其在木薯中的调控机制,利用Solexa测序技术在木薯中发现了大量的miRNAs,并利用一种新的miRNA定量检测技术(Multiplexed RT法)对其进行实验验证。通过对构建的3个小RNA文库进行Solexa测序与生物信息学分析,最终获得19个家族93个保守的miRNA和74个新的miRNA,实验验证了测序获得的83个miRNA。在Arg7块根中特异表达的有6个miRNA,分别为miR172d、miR396c、miR398a、miR398b、miR399e、miR399f,叶片中特异表达的有13个,须根中特异表达的有3个,这些miRNAs将为深入了解木薯块根发育和淀粉累积机理提供了一个新的视角。

分类号： S533

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