两种黄盖鲽线粒体DNA部分片段比较分析

文献类型: 中文期刊

第一作者: 张岩

作者: 张岩;肖永双;高天翔;于函

作者机构:

关键词: 钝吻黄盖鲽;尖吻黄盖鲽;线粒体DNA;核苷酸组成;分歧时间

期刊名称: 水产学报

ISSN: 1000-0615

年卷期: 2009 年 33 卷 02 期

页码: 201-207

收录情况: 北大核心 ; CSCD

摘要: 比较分析了钝吻黄盖鲽和尖吻黄盖鲽线粒体基因组COI、Cytb基因以及D-loop片段总长度为1 373 bp的核苷酸序列,两种间共检测到107处核苷酸替换,蛋白质编码基因上的核苷酸替代主要是第三密码子位点上的同义替换。核苷酸组成分析结果表明:3个目的片段的鸟嘌呤(G)含量普遍较低,在两个蛋白编码基因第三密码子位点上表现得尤为明显。两种黄盖鲽在线粒体基因组不同片段上存在明显的遗传分化,核苷酸替代速率最快的是D-loop,COI和Cytb核苷酸替代速率基本一致。建议在进行黄盖鲽属鱼类分子系统发育研究时,应该针对不同研究目的选择合适的分子标记。基于Cytb基因片段序列的分析结果表明:钝吻黄盖鲽和尖吻黄盖鲽两种的分岐时间约为200万年,两种间的分化事件发生在更新世(Pleistocene)。

分类号: S917.4

  • 相关文献

[1]基于线粒体DNA部分片段探讨石鲽与星突江鲽的亲缘关系. 肖永双,张岩,高天翔. 2010

[2]黄瓜花叶病毒甜瓜分离物外壳蛋白基因的克隆及序列分析. 古勤生,马新艳,刘丽锋,李宁,杨民和,彭斌,李莉. 2004

[3]钝吻黄盖鲽不同群体形态学比较研究. 张岩,肖永双,高天翔,范厚丽. 2010

[4]钝吻黄盖鲽精子冷冻保存及生理特性分析. 宋莉妮,田永胜,李祥孔,李洪,孙宗哲,陈张帆,李军,刘清华,陈松林. 2016

[5]低盐胁迫对钝吻黄盖鲽幼鱼鳃Na~+/K~+-ATP酶、肝脏抗氧化酶和非特异免疫酶的影响. 崔前进,陈冰,邱丽华,付旭,杨博学,韩雨哲,姜晨. 2017

[6]基于Roche 454 GS FLX的钝吻黄盖鲽(Pleuronectes yokohamae)微卫星标记的开发. 潘婷,张岩,张辉,高天翔,肖永双,姜云荣. 2015

[7]钝吻黄盖鲽野生群体遗传多样性分析. 张岩,肖永双,高天翔,陈四清,于函. 2008

[8]中国近海与日本近海白姑鱼线粒体细胞色素b基因全序列比较分析. 李昂,高天翔,孙典荣. 2010

[9]胭脂鱼细胞色素b基因序列测定及亚口鱼科系统进化分析. 张丽丽,万全,程起群. 2011

[10]九种鲱科鱼类线粒体DNA细胞色素b基因相对速率测试及分歧时间估计(英文). 程起群,卢大儒. 2006

[11]基于线粒体RNAs序列分析雁形目家禽的分歧时间. 郭军,汤青萍,章双杰,邹剑敏. 2011

[12]线粒体DNA在动物起源进化和遗传多样性中的应用. 肖海霞,帕热哈提江·吾甫尔,玉山江,王兵强,努力古丽·塔力甫汗,丁旭,托乎提·阿及德. 2015

[13]线粒体DNA的研究与应用. 熊庆,刘作易,喻子牛. 2002

[14]水稻细胞质雄性不育系和保持系的线粒体COⅠ、COⅡ基因组织结构差异的分析. 汪训明,王韫珠,卓德艮. 1988

[15]正常和细胞质雄性不育水稻线粒体DNA限制性内切酶的酶切图谱分析. 叶正祥,汪训明. 1988

[16]分子生物技术在确定物种迁移后遗传变异中的应用. 沈禹颖,侯扶江. 2002

[17]清远黄羽乌鸡mtDNA多态性及与9种具有药用价值乌鸡品种的亲缘关系研究. 何国戈,李莹,郑经成,王艳,葛影影,何静怡,胡克科,宋佳,罗成龙. 2019

[18]我国蛋用型地方鸡品种遗传多样性分析. 陆俊贤,贾晓旭,唐修君,樊艳凤,唐梦君,高玉时,苏一军. 2016

[19]中国北方沿海竿虾虎鱼(Luciogobius guttatus)隐存多样性与群体历史动态. 邓颖达,薛东秀,刘进贤. 2016

[20]基于线粒体DNAD-loop区全序列分析大围山微型鸡遗传多样性及其起源进化关系的研究. 贾晓旭,唐修君,陆俊贤,顾荣,葛庆联,高玉时,苏一军. 2015

作者其他论文 更多>>