利用SSR标记分析茄镰孢豌豆专化型的遗传多样性

文献类型: 中文期刊

第一作者: 向妮

作者: 向妮;肖炎农;段灿星;王晓鸣;朱振东

作者机构:

关键词: 豌豆根腐病;豌豆;Fusarium solani f.sp.pisi;SSR标记;遗传变异

期刊名称: 生物多样性

ISSN: 1005-0094

年卷期: 2012 年 20 卷 06 期

页码: 693-702

收录情况: 北大核心 ; CSCD

摘要: 由茄镰孢豌豆专化型(Fusarium solani f.sp.pisi,Fsp)引起的根腐病是豌豆(Pisum sativum)最重要的病害之一。研究不同地理来源Fsp的遗传多样性,对了解该菌的遗传背景及防治病害具有重要意义。本研究从血红丛赤壳交配群VI(Nectria haematococca MPVI)全基因组序列中筛选SSR位点,选取107个SSR位点设计引物,获得24对多态性引物。用24对多态性引物对不同地理来源的96个Fsp分离物进行遗传多样性分析,结果表明,24对引物共扩增出132个等位基因,变异范围为3-15,平均为5.5。基因多样性指数范围为0.4855-0.8264,平均为0.7038。供试的96个Fsp分离物可分为93个基因型。聚类分析表明,在相似性系数为0.8时,96个Fsp分离物被划分为10个组群。Fsp分离物的地理来源或致病性与SSR聚类结果无关。分子方差分析(AMOVA)结果表明,Fsp遗传变异主要存在于群体内,地理条件和生态区环境对Fsp遗传分化有显著影响。

分类号: S643.3

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