玉米茎腐病致病菌全基因组分泌蛋白预测与分析

文献类型： 中文期刊

第一作者： 曹言勇

作者： 曹言勇;张立立;李慧敏;韩胜博;侯梦薇;段灿星;施艳;张新友

作者机构：

关键词： 玉米;九州镰孢菌;生物信息学;分泌蛋白

期刊名称： 玉米科学

ISSN： 1005-0906

年卷期： 2024 年 004 期

页码： 110-118

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： 九州镰孢菌(Fusarium kyushuense)是一种重要的植物病原菌，可引起玉米茎腐病。为明确九州镰孢菌的分泌蛋白，运用SignalP 6.0、ProtComp 9.0、TMHMM 2.0、big-PI Predictor、TargetP 2.0等软件对九州镰孢菌全基因组12 225条蛋白质序列进行分泌蛋白的预测和筛选。结果表明，九州镰孢菌195全基因组蛋白中共有539条序列具有典型的分泌蛋白特征，占总序列数的4.41%。信号肽-3和-1位置的氨基酸相对保守，其切割位点属于A-X-A型。分泌蛋白功能注释分析结果表明，九州镰孢菌的分泌蛋白中共有264个效应蛋白，其功能主要涉及细胞壁组分降解。对碳水化合物活性酶类(CAZymes)进行预测发现，九州镰孢菌分泌蛋白组中共有168个碳水化合物活性酶，为进一步探究其生物学特性、致病机制和筛选新的镰孢菌致病效应蛋白奠定基础。

分类号： S435.131.4

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