番木瓜畸形花叶病毒外壳蛋白基因的克隆及序列分析

文献类型： 中文期刊

第一作者： 汪倩

作者： 汪倩;谭德冠;吴丽娟;孙雪飘;张家明

作者机构：

关键词： 番木瓜环斑病毒;畸形花叶病毒;外壳蛋白;相似性;系统发育树

期刊名称： 江苏农业科学

ISSN： 1002-1302

年卷期： 2012 年 40 卷 08 期

页码： 18-21

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： 从海南乐东的感病番木瓜叶片上提取总RNA,用RT-PCR方法扩增番木瓜环斑病毒(PRSV)外壳蛋白基因组序列。测序结果显示,该环斑病毒外壳蛋白基因扩增片段长867个核苷酸。相似性分析表明,该核苷酸序列与GenBank中报道的47株PRSV和1株畸形花叶病毒核苷酸序列的相似性在62.41%～94.71%之间。运用CLUSTALX和MEGA软件绘制系统进化树,结果表明,番木瓜PRSV病毒大致可分为美洲-澳洲类群和东亚-东南亚类群2大类,后者又可分为SB1、SB2、SB3等3个亚类。乐东毒株和已报到的畸形花叶病毒PaMLV病毒都属于PRSV。不过乐东毒株属于SB1亚类,而PaMLV属于SB2亚类。乐东毒株(JQ318029)和另一海南毒株(HQ424465)属于SB1亚簇,信心指数分别达到89%、83%、96%。不过乐东毒株与越南北部的4种毒株(AF506875、FN808408、AJ875115、U14742)的同源性更高,说明导致乐东畸形花叶病的毒株可能来自越南,而不是由海南本地毒株变异而来。

分类号： S436.67

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