基于BSA-seq技术对番茄封顶花序节位基因的精细定位

文献类型： 中文期刊

第一作者： 师海林

作者： 师海林;张丹丹;高倩;尤园园;舒金帅;王帅;毛秀杰

作者机构：

关键词： 自封顶番茄;混合群组分离分析测序（BSA-seq）;分子标记;基因定位

期刊名称： 农业生物技术学报

ISSN： 1674-7968

年卷期： 2023 年 007 期

页码： 1357-1367

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： 主茎花序数的多少影响着自封顶类型番茄（Solanum lycopersicum）的产量，精细定位其封顶花序节位基因，可为进一步基因克隆以及功能分析、调控机理解析提供依据。本研究以低节位自封顶番茄品系AXF和高节位自封顶番茄品系GXF为亲本构建F2分离群体，应用混合群组分离分析测序（bulked segregant analysis sequencing, BSA-seq）和分子标记方法进行了连锁分析及基因定位。结果表明，关联区间位于2号染色体47.56～47.59 Mb，大小约为25 497 bp，含有3个候选基因（硫代硫酸硫转移酶18（thiosulfatesul furtransferase 18, TST18）（GenBank No. XM＿004232452.4）, MLO类家族蛋白4（MLO-like protein 4, MLO4）（GenBank No. XM＿019212390.2）和26S蛋白酶体非ATP酶调节亚基4（26S proteasome non-ATPase regulatory subunit 4, PSMD4）（GenBank No. XM＿010318126.3））。进一步开发118对InDel（insertion-deletion）/CAPS（cleaved amplified polymorphism sequences）/dCAPS（derived CAPS）引物进行精细定位，筛选获得1对多态性高的dCAPS14分子标记，该标记与PSMD4紧密连锁。qRT-PCR分析表明该候选基因在两个亲本不同组织中的表达量存在显著性差异。PSMD4功能为参与泛素-蛋白酶体系统介导的蛋白降解，可能对番茄封顶花序节位起着重要调控作用。本研究对分子辅助选育易于栽培操作的理想型自封顶番茄品种具有重要意义。

分类号： S641.2

  • 相关文献

[1]黄瓜分子标记研究进展. 姜永平,张辉明,陈金鑫. 2008

[2]国外燕麦分子生物学研究进展. 王茅雁,齐秀丽,张凤英. 2001

[3]水稻光温敏雄性不育的遗传研究进展. 宋书锋,李娜. 2011

[4]小麦矮秆种质山农11069-5矮秆基因的遗传分析及分子定位. 杨秋平,杨阳,王鑫,马莹雪,张明,王洪刚. 2015

[5]分子标记技术在家畜育种中的应用. 詹海杰,曹亮,李燕平,牛晓艳,郑建婷,冯国亮. 2018

[6]基于分子标记和高通量测序的基因精细定位. 王茂辉,钟春燕,罗文龙,聂金泉,郭涛,王慧,陈志强. 2018

[7]数量遗传性状基因定位方法研究进展. 田玉,马春红,宋丽华,温之雨,董文琦,赵璞. 2021

[8]分子标记技术及其在水稻基因定位上的应用. 孙正文,黄兴奇,李维蛟,钟巧芳,余腾琼,郭怡卿,李定琴,殷富有,程在全. 2011

[9]小麦抗麦双尾蚜研究进展. 段灿星,朱振东,王晓鸣,张世贤,戴法超. 2003

[10]DNA分子标记技术在芝麻中的应用. 王瑾,徐桂真,李玉荣,程增书,陈四龙. 2009

[11]水稻株高基因eui的初步分子定位. 吴玉良,何祖华,董继新,李德葆,林鸿宣,庄杰云,陆军,郑康乐. 1998

[12]对家蚕第18连锁群隐性基因elp、ch-2和mln测交系的分子定位分析. 刘先方,马晓,侯成香,李冰,李木旺. 2013

[13]水稻抗穗瘟基因的分子定位. 吴建利,庄杰云,柴荣耀,樊叶扬,金敏忠,李德葆,郑康乐. 2000

[14]水稻淡褐斑叶突变体lbsll的遗传分析与基因定位. 奉保华,杨杨,施勇烽,林璐,陈洁,黄奇娜,魏彦林,HeiLEUNG,吴建利. 2012

[15]水稻野生种质优异基因分子标记定位和利用的研究进展. 谢建坤,孔祥礼,包劲松,万勇. 2004

[16]彩色棉与白色棉之间的DNA分子标记研究. 张秉贤,王国祥. 2001

[17]水稻穗部突变体Cl的形态和定位分析. 郑雷英,朱旭东,钱前,赵忠,张建军,胡筱荷,林鸿宣,罗达. 2003

[18]分子标记在绿豆遗传连锁图谱构建和基因定位研究中的应用. 叶卫军,杨勇,周斌,田东丰,张丽亚. 2017

[19]芸薹属作物分子标记研究. 陈书霞,王晓武,程智慧,房玉林. 2000

[20]籼稻9311HR-T显性高秆基因的初步定位. 陈仁霄,ZHANG Suo-bing,张所兵,朱镇,赵凌,张亚东,王才林. 2008

作者其他论文 更多>>

微信小程序