天祝白牦牛DLX-3基因克隆及生物信息学与差异表达分析

文献类型： 中文期刊

第一作者： 郭雪峰

作者： 郭雪峰;常永芳;包鹏甲;张永峰;李忠邦;阎萍;潘和平

作者机构：

关键词： DLX-3基因;天祝白牦牛;生物信息学;基因表达

期刊名称： 基因组学与应用生物学

ISSN： 1674-568X

年卷期： 2020 年 39 卷 011 期

页码： 5001-5009

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： 本研究以天祝白牦牛体侧皮肤为实验材料,通过PCR扩增技术克隆DLX-3基因CDs区,将克隆获得的天祝白牦牛DLX-3基因CDs区序列与野牦牛序列比对并进行生物信息学分析;采用实时荧光定量PCR检测天祝白牦牛DLX-3基因在毛囊发育不同月份的mRNA表达水平.结果 表明,天祝白牦牛DLX-3基因编码区序列长864 bp,编码287个氨基酸残基;天祝白牦牛DLX-3基因编码蛋白分子量31 720.20 Da,理论等电点为8.98;蛋白质二级结构以无规卷曲(74.91%)和α-螺旋(15.33%)为主,序列分析显示,天祝白牦牛DLX-3蛋白为不稳定的亲水蛋白.实时荧光定量PCR检测天祝白牦牛DLX-3基因在毛囊发育1、3、6、10、12月份的表达量,检测结果表明DLX-3基因1、3、6、10、12月份均有表达,且在10月份的表达量显著高于其他月份(p<0.05),此时牦牛皮肤毛囊发育活动开始进入生长期阶段;DLX-3基因在牦牛皮肤发育生长旺盛阶段的表达量最高,可能参与调控毛囊发育,并在毛囊活动中呈现明显的表达规律,表明DLX-3基因对天祝白牦牛毛囊发育周期的重要性,为进一步研究天祝白牦牛DLX-3基因对毛囊发育调控及其功能的研究提供了理论基础.

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