美仁牦牛MYL9基因克隆、生物信息学分析及组织表达研究

文献类型： 中文期刊

第一作者： 马荣

作者： 马荣;喇永福;包鹏甲;郭宪;路建卫;扎老;赵雪;梁春年;成述儒

作者机构：

关键词： 美仁牦牛;MYL9基因;克隆;生物信息学;组织表达

期刊名称： 中国畜牧兽医

ISSN： 1671-7236

年卷期： 2024 年 51 卷 004 期

页码： 1410-1419

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： [目的]克隆美仁牦牛肌球蛋白轻链9(myosin light chain 9,MYL9)基因CDS区并对其进行生物信息学分析,检测MYL9基因的组织表达特征,为探究该基因功能提供一定理论依据.[方法]以美仁牦牛肌肉组织cDNA为模板,利用PCR扩增并克隆美仁牦牛CDS区序列,与其他物种进行相似性比对及系统进化树构建;通过在线软件对MYL9蛋白进行生物信息学分析,利用实时荧光定量PCR检测MYL9基因在美仁牦牛心脏、肝脏、脾脏、肺脏、肾脏、肌肉、脂肪和睾丸组织中表达情况.[结果]美仁牦牛MYL9基因CDS区长516 bp,共编码171个氨基酸.系统进化树结果显示,美仁牦牛与野牦牛、普通牛亲缘关系最近,与高山倭蛙亲缘关系最远.MYL9蛋白分子式为C858 H1324 N234 O274 S12,原子数为2 702,理论等电点为4.85,不稳定系数和总平均亲水性分别为37.22和-0.772,属于稳定亲水性蛋白.MYL9蛋白无信号肽和跨膜螺旋结构,属于非分泌性蛋白;主要定位于线粒体、细胞核、细胞质中,具有17个特异性磷酸化位点.MYL9蛋白二级结构主要由α-螺旋、无规则卷曲、β-折叠和延伸链构成,三级结构预测结果与二级结构一致.实时荧光定量PCR结果显示,MYL9基因在美仁牦牛心脏、肝脏、脾脏、肺脏、肾脏、肌肉、脂肪和睾丸组织中均表达,且肝脏和肌肉组织中表达量显著高于其他组织(P<0.05).[结论]本研究成功克隆美仁牦牛MYL9基因CDS区,探究了 MYL9基因的生物学功能及组织表达特征,研究结果为进一步探究牦牛MYL9基因功能特征提供了参考.

分类号： S823.8+5

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