江苏蚕豆三叶草黄脉病毒的分子鉴定及全基因组结构特征分析

文献类型: 中文期刊

第一作者: 高晓晓

作者: 高晓晓;涂丽琴;孙枫;李硕;崔晓艳;陈新;章松柏;季英华

作者机构:

关键词: 三叶草黄脉病毒;蚕豆;全基因组;序列分析

期刊名称: 江苏农业学报

ISSN:

年卷期: 2022 年 005 期

页码: 1203-1210

收录情况: 北大核心 ; CSCD

摘要: 三叶草黄脉病毒(Clover yellow vein virus, ClYVV)是马铃薯Y病毒属的重要成员,侵染多种豆科作物并造成严重危害。为明确从江苏省盐城市采集的蚕豆样品中检测出的ClYVV全基因组序列以及基因组结构特征,通过分段扩增的策略对ClYVV全基因组序列进行克隆,序列测定后拼接获得江苏蚕豆三叶草黄脉病毒(ClYVV-JS)全基因组序列。基因组序列分析结果显示该分离物基因组序列全长9 585 bp,编码11个蛋白质。NCBI序列比对结果表明该分离物与已报道的日本ClYVV No.30分离物(AB011819)核苷酸序列同源性最高,达96.37%,其中编码的氨基酸序列同源性高达99.06%,而与中国合肥ClYVV分离物(KU922565)核苷酸序列同源性相对较低(94.74%)。聚类分析结果也显示ClYVV-JS归入三叶草黄脉病毒分支,与马铃薯Y病毒属其他成员分别归入不同分支。

分类号: S436.43

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