Mapmarker/Exp3.0遗传图谱构建中重要参数设置初步探讨

文献类型： 中文期刊

第一作者： 赖运平

作者： 李俊;董雪芳;张泽全;魏会廷;彭正松;胡晓蓉;杨武云

作者机构：

关键词： Mapmarker/Exp3.0;遗传连锁图谱;LOD值

期刊名称： 西南农业学报

ISSN： 1001-4829

年卷期： 2009 年 22 卷 06 期

页码： 1508-1513

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： Mapmarker/Exp(3.0)是目前分子作图中应用最广的软件之一,但由于许多重要参数的默认值并非是作图的最佳值,影响提高作图的精确性。本文以川麦42×川农16重组近交系(F8)作图群体为实例,对Mapmarker/Exp 3.0软件在遗传作图中不同LOD值、max distance值以及用compare and try、compare和order 3种排序方式对遗传图谱的影响进行了初步比较,结果表明,作图过程中,不应强求采取统一LOD值,对于特殊的连锁群可采取不同的LOD值;max distance值在20至50为宜,值过小容易遗漏大量本来正确连锁的标记;小于等于7个标记的连锁群可直接用compare命令排序。

分类号： S188

  • 相关文献

[1]人工养殖鲶的TRAP遗传分析. 葛学亮,孙中武,尹洪滨. 2010

[2]向日葵高密度遗传连锁图谱构建及两种水分条件下芽期性状的QTL分析. 吕品,于海峰,于志贤,张永虎,张艳芳,王婷婷,侯建华. 2017

[3]三疣梭子蟹遗传连锁图谱的初步构建. 罗云,高保全,刘萍,李健,戴芳钰. 2010

[4]甘蔗SSR和AFLP分子遗传连锁图谱构建. 刘新龙,毛钧,陆鑫,马丽,Karen Sarah AITKEN,Phillip Andrew JACKSON,蔡青,范源洪. 2010

[5]SSR分子标记丰富向日葵(Helianthus annuus L.)遗传图谱的研究(英文). 黄先群,Genzbitelle L.,Fabre F.,Saraffi A.. 2012

[6]SSR分子标记丰富向日葵(Helianthus annuus L.)遗传图谱的研究. 黄先群,Genzbitelle L.,Fabre F.,Saraffi A.. 2012

[7]长果种黄麻SRAP标记遗传连锁图谱的构建及3个质量性状基因定位. 陈晖,陈美霞,陶爱芬,张广庆,徐建堂,祁建民,方平平. 2011

[8]利用SSR标记技术构建黄瓜遗传连锁图谱. 王军辉,崔兴华,张桂华,杜胜利,张显. 2010

[9]玉米SSR连锁图谱构建及抗纹枯病基因定位. 赵茂俊,张志明,张世煌,李晚忱,MARIA LUZ C.GEORGE,潘光堂. 2005

[10]结球甘蓝AFLP、SSR、SRAP标记高密度遗传图谱构建. 朱洪运,颉建明,郁继华,简元才,康俊根. 2013

[11]利用Bayesian方法进行牙鲆体质量和主要形态性状的QTL定位及互作分析. 崔妍,高会晓,仇雪梅,杨润清,刘海金. 2015

[12]花椰菜遗传图谱的构建及NBS-LRR类抗性同源基因在图谱中的定位. 古瑜,赵前程,孙德岭,宋文芹. 2007

[13]稻瘟病菌株CH63和TH16杂交组合的遗传图谱构建及无毒基因定位. 王艳丽,Claudia KAYE,Amandine BORDAT,Henri ADREIT,Jo■lle MILLAZZO,郑小波,沈瑛,Didier THARREAU. 2005

[14]多年生黑麦草分子标记应用及基因组研究进展. 刘晓强,赵海滨,李新玲,张延明. 2020

[15]甘蓝型油菜多主花序性状的表型特点与遗传分析. 陆红臣,仵汉飞,文静,易斌,马朝芝,涂金星,傅廷栋,沈金雄. 2019

[16]基于CAPS标记的甜瓜单果重相关性状QTL分析. 刘相玉,张裕舒,刘柳,刘识,高鹏,王迪,王学征. 2019

[17]甘蓝型油菜遗传图谱构建及产量相关性状QTL定位研究进展. 星晓蓉,柳海东. 2019

[18]蚕豆遗传图谱与QTL定位研究进展. 周仙莉,滕长才,张红岩,林夕,刘玉玲,吴小燕,侯万伟,刘玉皎. 2021

[19]利用SNP标记定位瓠瓜果形相关性状QTLs. 汪颖,黄莉娟,徐沛,吴晓花,吴新义,汪宝根,鲁忠富,李艳伟,李国景. 2020

[20]中国对虾遗传连锁图谱的构建. 田燚,孔杰,王伟继. 2008

作者其他论文 更多>>

微信小程序