番茄黄化曲叶病毒石家庄分离物的分子鉴定及序列分析

文献类型： 中文期刊

第一作者： 白晓娟

作者： 白晓娟;李亚栋;王国华;尹庆珍;耿保进;董文琦;周春江;吴志明

作者机构：

关键词： 番茄;番茄黄化曲叶病毒(TYLCV);DNA-A;分子鉴定;序列分析

期刊名称： 园艺学报

ISSN： 0513-353X

年卷期： 2015 年 42 卷 01 期

页码： 167-173

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： 根据番茄黄化曲叶病毒(Tomato yellow leaf curl virus,TYLCV)基因组序列的复制酶保守区设计1对引物JC1,对石家庄具有典型番茄黄化曲叶病毒症状的番茄样品进行检测,经PCR扩增得到626 bp的片段,序列分析比对表明其为TYLCV的一部分。根据上述序列设计1对特异引物QC,通过PCR分离石家庄的TYLCV全长序列并进行测序。同时利用已报道的DNA-B的通用引物CR01/CR02进行PCR扩增。结果表明石家庄分离物只含有DNA-A组分,全长为2 781 bp(Gen Bank登录号:KF612971),命名为TYLCV-Shijiazhuang。基因组序列比较发现,该分离物与TYLCV-Israel株系相似性为99.0%。基因组序列系统进化分析表明,石家庄病毒分离物与北京分离物TYLCV-Beijing3(Gen Bank登录号:GU983859)、山东分离物TYLCV-SDSG-XC(Gen Bank登录号:KC999851)序列相似性很高,均属于TYLCV-Israel分支。

分类号： S436.412.11

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