O型口蹄疫病毒各编码基因及其产物变异率的分析

文献类型： 中文期刊

第一作者： 周建华

作者： 周建华;丛国正;常惠芸

作者机构：

关键词： 口蹄疫病毒;相对变异率;方差分析;Duncan法

期刊名称： 华北农学报

ISSN： 1000-7091

年卷期： 2009 年 24 卷 01 期

页码： 64-67

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： 将从Genbank中提出的20株O型FMDV的全基因组分割成12个编码区域,即Lab、VP4、VP2、VP3、VP1、2A、2B、2C、3A、3B、3C和3D。通过方差分析,12个编码序列的相对变异率之间无差异(P>0.05);而这12种编码序列所对应的氨基酸相对突变率之间差异显著(P<0.01)。利用Duncan法对这12种氨基酸序列相对突变率进行多重比较,发现3A蛋白的氨基酸相对突变率比其余11种蛋白的差异都显著(P<0.05);VP2、Lpro的氨基酸相对突变率与VP4、2A、2C、3Cpro、3Dpol之间存在差异(P<0.05);而VP4、2A、2C、3Cpro、3Dpol之间无差异。结果显示,O型FMDV自身RNA的转录和机体对FMDV施加的免疫压力不是造成FMDV变异的主要原因,而各种病毒产物的功能选择压力才是FMDV分子进化的主要原因。

分类号： S852.65

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