运用SLAF-seq技术构建水稻高密度遗传图谱

文献类型： 中文期刊

第一作者： 彭强

作者： 彭强;叶生鑫;黄龙;张大双;刘颖;吴健强;张玉珊;朱速松

作者机构：

关键词： 水稻;遗传图谱;特定位点扩增片段;作图群体

期刊名称： 分子植物育种

ISSN： 1672-416X

年卷期： 2016 年 14 卷 08 期

页码： 2127-2132

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： 对精细定位某一特定性状位点来说,高密度遗传图谱是一个非常实用的工具。本研究以水稻品种V20B/CPSLO17组合衍生的150份重组自交家系作为作图群体,利用特定位点扩增长度测序(SLAF-seq)技术,一种基于下一代测序技术进行大规模开发SNP和基因型分析的高通量新策略,开发SLAF标签和构建水稻高密度遗传图谱。我们共检测到67 017个高质量的SLAF标签,其中多态性SLAF有15 853个,符合构建高质量遗传图谱使用要求的多态性SLAF标签有8 657个。最终成功构建了一个包含12个连锁群,8 602个上图标记,总图距为2 508.65 c M,标记间平均距离为0.29 c M的高密度遗传图谱,该图谱可用于重要农艺性状QTL定位。

分类号： S511`Q943.2

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