陆地棉水通道蛋白GhNIP6.1基因的克隆及表达分析

文献类型： 中文期刊

第一作者： 巩元勇

作者： 巩元勇;郭书巧;束红梅;倪万潮

作者机构：

关键词： 陆地棉;水通道蛋白;GhNIP6.1;表达序列标签

期刊名称： 棉花学报

ISSN： 1002-7807

年卷期： 2013 年 25 卷 01 期

页码： 1-8

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： 根据EST拼接的序列设计引物,利用RT-PCR技术,从陆地棉品种苏棉18中克隆获得了一个水通道蛋白基因GhNIP6.1。该基因开放阅读框包含903个核苷酸,编码300个氨基酸,分子量为30.97kD,理论等电点为8.99。GhNIP6.1蛋白的生物信息学分析表明:GhNIP6.1含有6个跨膜区,由5个环相连,其中环A、C和E在细胞膜外,环B、D和蛋白的N、C末端都位于细胞膜内,N末端79个氨基酸,C末端18个氨基酸,具有MIP家族典型的保守氨基酸序列;该蛋白的三级结构同拟南芥的AtNIP6.1非常相似,亚细胞定位也同AtNIP6.1一致,可能位于质膜中。进化分析发现,GhNIP6.1蛋白同拟南芥的AtNIP6.1蛋白相似性最高。进一步扩增棉花核基因组获得了2021bp的DNA序列,它包含5个外显子和4个内含子,所有外显子/内含子交接点都遵从gt/ag剪接规则。半定量分析表明,该基因在根、茎和叶中都有表达,其中真叶含量较高,子叶中没有表达。

分类号： S562

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