大规模标记数据的遗传分群和排序算法研究

文献类型： 中文期刊

第一作者： 姜兴丽

作者： 姜兴丽;李慧慧;李仲来;王建康

作者机构：

关键词： 连锁图谱;层次聚类算法;排序算法;旅行商问题;计算机模拟

期刊名称： 第六届全国动植物数量遗传学学术研讨会论文摘要集

ISSN：

年卷期： 2014 年

页码： 1

收录情况： CSCD

摘要： 准确的连锁图谱是开展数量性状基因定位和图位克隆等遗传研究的前提。随着现代分子生物技术的不断发展,人们可以比较容易地获得高通量分子标记,这为高密度遗传连锁图谱的构建提供了契机。但同时,标记数量的巨增也为连锁图谱构建算法提出了极大的挑战。建立连锁图谱的第一步是将来自不同染色体的标记进行分群,而后对每个连锁群中的标记进行排序,寻求图距最短的一个标记顺序。本研究中我们将待分群数作为唯一参数,利用层次聚类算法将标记划分到相应的连锁群

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