陆地棉转录因子WRKY29的鉴定及表达分析
文献类型: 中文期刊
第一作者: 刘文豪
作者: 刘文豪;余渝;王旭文;田琴;吴珂;马麒;赵福相;孔宪辉
作者机构:
关键词: WRKY29;转录因子;生物信息学;育种
期刊名称: 安徽农业科学
ISSN: 0517-6611
年卷期: 2023 年 023 期
页码: 85-89
摘要: [目的]揭示WRKY29基因表达机理,为分子辅助育种创新种质提供基因资源。[方法]以WRKY家族成员中的WRKY29为目标,通过生物信息学方法分析陆地棉WRKY29转录因子的理化性质、系统进化关系、亚细胞定位建模和染色体分布定位、基因的组织特异性表达。[结果]生物信息学分析表明,陆地棉WRKY29转录因子含有279个氨基酸残基,理论等电点为6.08,具有典型的WRKY保守结构域,属于不稳定蛋白。蛋白质二级结构以α螺旋和无规卷曲为主。系统进化关系分析得知WRKY29与同为锦葵目的物种聚类在同一进化分支,亚细胞定位预测WRKY29转录因子分布在细胞核,而染色体定位发现WRKY29转录因子分布在A02染色体40~48 Mb区域内。WRKY29转录因子具有正调控功能,组织表达模式发现在根部具有显著性表达。[结论]陆地棉转录因子WRKY29的鉴定及表达分析为棉花生长发育过程中的抗逆研究提供了重要线索。
分类号: S562
- 相关文献
[1]枸杞MYB103转录因子的生物信息学分析. 尹跃,曹有龙,陈晓静,赵建华. 2012
[2]急性T淋巴细胞性白血病关键基因的筛选与验证. 蒋光洁,陈燕华,郭维,张航,邹琳. 2018
[3]一个新的葡萄抗逆转录因子VvERF2基因的In silico克隆及生物信息学分析. 高峰,熊爱生,彭日荷,李贤,蔡斌,薛永,付晓燕. 2008
[4]硒都黑猪NT5C1A基因核心启动子区鉴定及转录因子预测. 任双,吴俊静,彭先文,张志红,周佳伟,梅书棋,乔木,杜志强. 2024
[5]基于RNA-seq技术的茶树CsbHLH62生物信息学分析. 曹丹,金孝芳,马林龙,刘艳丽,郭桂义. 2019
[6]辣椒WOX转录因子家族的鉴定、进化与表达分析. 张烨达,王星,王丽萍,佟静,武占会,高彦魁. 2023
[7]甘蓝型油菜‘沪油15'中两个CBF类转录因子的克隆与分析. 庄静,朱波,金晓芬,彭日荷,乔玉山,章镇,熊爱生,姚泉洪. 2008
[8]软枣猕猴ICE1基因克隆与生物信息学分析. 张庆田,范书田,李昌禹,艾军,秦红艳. 2019
[9]水稻转录因子NF-YB家族的生物信息学分析. 余东,孙志忠,孙学武,谭炎宁,盛夏冰,段美娟,袁定阳. 2018
[10]拟南芥AtOFP8的生物信息学分析及表达分析. 唐尧,张微,尹艳莉,冯鹏,陈宇峰,常缨. 2018
[11]芒果果实bHLH家族转录因子的生物信息学分析. 郑斌,文定青,武红霞,邹明宏,刘恒,王松标,赵巧丽. 2019
[12]海南龙血树4个DcTIFY10转录因子的鉴定和表达分析. 丁旭坡,马纳纳,庞宽壮,蔡彩虹,戴好富,梅文莉. 2019
[13]森林草莓全基因组MADS-box转录因子基因的鉴定及凤梨草莓果实FaMADS1基因克隆. 周厚成,李刚,赵霞,康兆茹,郭蔼光. 2014
[14]杧果转录因子BES1s家族全基因组鉴定及生物信息学分析. 夏煜琪,孙宇,刘志鑫,孙瑞青,杨楠,蒲金基,张贺. 2022
[15]辣椒全基因组WRKY转录因子的分析. 刁卫平,王述彬,刘金兵,潘宝贵,郭广君,戈伟. 2015
[16]高温胁迫下酸枣WRKY转录因子的鉴定及表达分析. 张欢,靳娟,樊丁宇,郝庆,杨磊,牛建新. 2022
[17]玉米bZIP转录因子的生物信息学分析. 于滔,王成波,曹士亮,孙培元. 2016
[18]越橘果实转录组及R2R3-MYB转录因子分析. 宋杨,刘红弟,张红军,窦连登. 2015
[19]苹果WRKY基因家族生物信息学及表达分析. 谷彦冰,冀志蕊,迟福梅,乔壮,徐成楠,张俊祥,董庆龙,周宗山. 2015
[20]普通烟草WRKY基因家族的鉴定及表达分析. 向小华,吴新儒,晁江涛,杨明磊,杨帆,陈果,刘贯山,王元英. 2016
作者其他论文 更多>>
-
陆地棉主要株型性状关联分析及优异等位基因挖掘
作者:王娟;王新;田琴;马晓梅;周小凤;李保成;董承光
关键词:陆地棉;株型性状;关联分析;优异等位基因
-
彩色棉品种金垦棕11号选育及栽培技术要点
作者:李吉莲;马麒;宁新柱;徐守振;陈红;刘萍;谢斌;刘齐峰;林海
关键词:彩色棉;金垦棕11号;品种选育;优质;抗病;栽培技术
-
早熟陆地棉新品种新垦M2001选育及栽培技术
作者:董承光;周小凤;马晓梅;王新;田琴;李保成
关键词:棉花;品种选育;新垦M2001;早熟;优质
-
无人机喷施化学打顶剂在棉花上应用的试验研究
作者:卢小燕;陈兵;余渝;王映山;赵静;徐明军
关键词:棉花;无人机;打顶剂;施药效果;产量;品质
-
60Co-γ射线抑制棉种萌发和幼苗生长
作者:彭小峰;张选;彭延;刘素华;黎蓉;孔宪辉;艾尼玩尔·黑里力;魏传井
关键词:棉花;伽马射线;辐照;萌发;根生长;成苗率
-
新疆兵团第三师棉花干播湿出技术推广应用成效
作者:王潭刚;郝全有;刘英刚;马丽;崔建强;贾梦梦;孔松;孔宪辉
关键词:棉花;干播湿出;含盐量;灌溉
-
气候差异对新陆早61号生物学特性及品质的影响
作者:周小凤;董承光;马晓梅;王新;田琴
关键词:棉花;生物学特性;纤维品质;气候差异