烟草野火病菌Pseudomonas syringae pv. tabaci yuexi-1信号肽预测及分析

文献类型： 中文期刊

第一作者： 王铁霖

作者： 李晶;杨玉文;赵廷昌

作者机构：

关键词： Pseudomonas syringae pv.tabaci;信号肽;SignalP 4.0;LipoP 1.0;TMHMM v2.0

期刊名称： 中国烟草学报

ISSN： 1004-5708

年卷期： 2016 年 22 卷 1 期

页码： 92-100

收录情况： 北大核心

摘要： 利用SignalP 4.0、LipoP 1.0及TMHMM v2.0对烟草野火病菌Pseudomonas syringae pv. tabaci yuexi-1菌株基因组中信号肽的数量、长度和氨基酸组成进行了预测及分类。结果确定其中432个ORFs (Open reading frame)所编码的N端有信号肽序列,占全部ORFs的8.81%。其中351条分泌型信号肽(SPI), 81条脂蛋白型信号肽(SPII)。在分泌型信号肽中,信号肽的长度为II?42个氨基酸,以长度为22个氨基酸的信号肽最多。同源性分析结果显示,具有相同信号肽序列的不同蛋白序列之间是高度保守的。该研究提供了野火病原菌致病因子的备选基因,提高该病菌致病因子的筛选效率。

分类号：

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