山竹子基因组DNA提取及SRAP反应体系优化

文献类型: 中文期刊

第一作者: 邹明宏

作者: 邹明宏;郭凌飞;曾辉;杜丽清;陆超忠;罗炼芳;张汉周

作者机构:

关键词: 山竹子;DNA提取;SRAP;体系优化

期刊名称: 经济林研究

ISSN: 1003-8981

年卷期: 2009 年 27 卷 03 期

页码: 41-44

摘要: 采用改良CTAB法提取山竹子基因组DNA,并以me1和em3正反向引物组合对山竹子进行了SRAP体系的优化。结果表明:使用CTAB free缓冲液进行前处理可去除大部分的杂质,获得的DNA纯度较高,OD260/OD280均在1.7~1.9之间,RNA消化彻底,DNA无明显降解,进行SRAP分析条带清晰,多态性好。在25μL反应体系中,5种主要成分的适宜浓度或用量分别是:Taq DNA聚合酶0.5 U,Mg2+2.0 mmol.L-1,dNTPs 0.15~0.2 mmol.L-1,模板DNA 10~50 ng,引物0.6~0.8μmol.L-1。该体系适用于山竹子SRAP分析,进行遗传图谱构建、基因定位与克隆、比较基因组学、遗传多样性、cDNA指纹图谱等方面的研究。

分类号: S792.99

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