东方田鼠部分BAC文库的微卫星筛选

文献类型： 中文期刊

第一作者： 汤敏

作者： 汤敏;倪丽菊;高骏;肖君华;胡建华;高诚

作者机构：

关键词： 东方田鼠;BAC文库;微卫星;菌落杂交;链霉亲和素磁珠

期刊名称： 中国实验动物学报

ISSN： 1005-4847

年卷期： 2012 年 20 卷 03 期

页码： 50-55

收录情况： CSCD

摘要： 目的从东方田鼠的部分BAC文库中筛选微卫星。方法应用非放射性的菌落杂交方法和磁珠富集法从东方田鼠的BAC文库中筛选高质量的微卫星标记。结果以地高辛标记的寡聚核苷酸(CA)20为探针,通过菌落杂交法从136个东方田鼠BAC克隆中筛选出杂交信号最强的20个阳性克隆。再将这20个阳性克隆分别通过链霉亲和素磁珠法构建亚克隆文库,从中选取400个经PCR鉴定为阳性的亚克隆进一步测序分析,共得到220个微卫星序列,阳性率55%。选取重复次数高,侧翼序列完整的微卫星序列设计74对引物,共有35对引物能扩增出清晰的条带,其中16对引物具有多态性。结论成功且高效地从阳性BAC克隆中筛选出微卫星序列,这些微卫星和阳性BAC克隆可用于后续的定位研究。

分类号： Q95-33

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