菠萝NAC转录因子基因AcoNAC1生物信息学及表达分析

文献类型： 中文期刊

第一作者： 谭秦亮

作者： 谭秦亮;蔡元保;杨祥燕;李穆;李季东;黄思婕;程琴;庞新华;朱鹏锦;周全光

作者机构：

关键词： 菠萝;NAC转录因子;生物信息学分析;逆境胁迫

期刊名称： 热带作物学报

ISSN：

年卷期： 2021 年 002 期

页码： 310-316

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： NAC转录因子作为植物中数量最大的转录因子家族之一,在植物生长发育及各种逆境胁迫中发挥非常重要的调控作用。本研究以菠萝为试验材料,采用RT-PCR技术克隆得到基因AcoNAC1（GenBank登录号:XM020225830）,对其进行生物信息学及表达分析。生物信息学分析表明,该基因cDNA序列全长1723 bp,ORF为1062 bp,编码353个氨基酸,相对分子量为38.34kDa,理论等电点为8.88;其编码蛋白的二级结构由20.40%的α-螺旋（H）和15.30%的β-折叠（E）以及59.21%的无规则卷曲（C）组成,具有NAC典型结构保守域。基因表达分析表明,AcoNAC1基因的表达受低温和干旱胁迫诱导,低温胁迫24 h和干旱胁迫12 h时的表达量最高;在不同成熟期品种中表现出持续的诱导表达,但诱导强度逐渐下降,其中早熟品种谢花后20～50 d及晚熟品种谢花后20～60 d基因表达量均处于较高水平。因此,推测AcoNAC1基因可能参与菠萝逆境胁迫响应以及果实发育与成熟的调控。

分类号： S668.3

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