猪嵴病毒441株3D基因的克隆及序列分析

文献类型： 中文期刊

第一作者： 王恩丽

作者： 王恩丽;兰喜;刘伟;杨彬;柳纪省;马小军

作者机构：

关键词： swKoV CH441株;RT-PCR;3'RACE;3D基因;序列分析

期刊名称： 生物技术通报

ISSN： 1002-5464

年卷期： 2013 年 0 卷 11 期

页码： 148-152

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： 根据GenBank中登录的猪嵴病毒(porcine kobuvirus,PKV)核苷酸序列设计引物,利用RT-PCR技术及3'RACE法扩增猪嵴病毒441株(swKoV CH441株)3D基因。成功扩增了swKoV CH441株的3D基因,3'非编码区(3'untranslated region,3'UTR)及Poly(A),扩增的基因片段长度分别为1 064、1 046和592 bp,包括3A、3B、3C、3D基因序列,3'UTR序列和一个至少含有29个Poly(A)的尾巴。序列分析结果表明,swKoV CH441株3D基因全长1 407 bp,编码468个氨基酸,分子质量约为53 369.29 D,理论等电点为6.12;3'UTR位于终止密码子TGA之后,长166 bp;swKoV CH441株与其他猪嵴病毒3D基因核苷酸序列相似性在92.2%-93.4%,氨基酸一致性为97.9%-99.4%。遗传进化分析表明,swKoV CH441株与国内株亲缘关系较近,与匈牙利株亲缘关系较远。

分类号： S852.65

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