鲉形目鱼类DNA条形码分析及鲉科DNA条形码电子芯片建立

文献类型： 中文期刊

第一作者： 柳淑芳

作者： 柳淑芳;李献儒;杨钰;杨善军;庄志猛

作者机构：

关键词： 鲉形目;鲉科;DNA条形码;DNA条形码芯片

期刊名称： 中国水产科学

ISSN： 1005-8737

年卷期： 2016 年 23 卷 05 期

页码： 1006-1022

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： 为建立鲉形目内各物种的快速鉴别方法,本研究扩增了我国47个鲉形目物种并下载了Gen Bank上收录的鲉形目共计23科85属233种873条细胞色素C氧化酶I基因(COI)序列,分析该基因结构特性。结果表明,鲉形目DNA条形码基因的碱基变异中,不变位点508个,占总位点数的82.1%;转换位点70个,颠换位点41个,分别占总位点数的11.3%和6.6%;种内遗传距离为0~0.019,平均遗传距离为0.003?0.0034;属内种间遗传距离为0.003~0.258,平均值为0.086?0.038;基于233个物种的COI序列构建的系统进化树显示,227个物种(97.4%)能聚为独立分支,且具有较高支持度。在此基础上以鲉科11属39种鱼类的DNA条形码为例,筛选出25个种的37个特异性探针,以此探针对鲉科鱼类进行物种快速鉴定成功率为64.1%,研究结果表明DNA条形码芯片用于鲉科的鉴定具有一定的可行性。

分类号： S917.4

  • 相关文献

[1]动物DNA条形码鉴定技术及其在害虫种类鉴定中的应用. 张莉,苏生,吕召云,孟泽洪. 2014

[2]腐霉属DNA条形码初步探究. 韦继光,郭良栋,邓晖. 2010

[3]基于DNA条形码的物种界定算法比较研究-以北京周边地区舟蛾科为例. 金倩,武春生,陈芬,罗桂杰,蔡卫佳,刘旭,杨采青,郝梦迪,张爱兵. 2017

[4]DNA条形码技术在食品溯源中的应用. 李敏,凌超,邬琦沁,毕盛楠,樊蕴秀,孙国伟,韩奕奕,郑小平,孟瑾. 2014

[5]荣成俚岛斑头鱼摄食生态研究. 纪东平,卞晓东,宋娜,高天翔. 2015

[6]鳀科(Engraulidae)鱼类DNA条形码电子芯片研究. 柳淑芳,李献儒,李达,庄志猛. 2016

[7]两株北极褐藻DNA条形码序列的记录. 刘晨临,林学政. 2017

[8]基于COⅠ基因的西南大西洋部分经济鱼类DNA条形码鉴定. 张馨月,刘岩,张秀梅,高天翔. 2014

[9]基于线粒体COI基因序列的5种鲤养殖品种遗传多样性研究. 单云晶,鲁翠云,李超,张明昭,顾颖,孙效文. 2013

[10]狼山鸡保种群不同世代线粒体COⅠ基因条形码变化规律研究. 屠云洁,束婧婷,章明,苏一军,单艳菊,姬改革,邹剑敏. 2016

[11]基于DNA条形码技术对镰刀菌属的检测鉴定. 雷娅红,况卫刚,郑春生,李秀璋,高文娜,李春杰. 2016

[12]基于线粒体C01基因的DNA条形码在石首鱼科(Sciaenidae)鱼类系统分类中的应用. 柳淑芳,陈亮亮,戴芳群,庄志猛. 2010

[13]一种紫芝重要害虫-台湾斑谷蛾. 徐淼锋,廖永林,林伟,刘若思. 2022

[14]基于高基元SSR构建黍子DNA分子身份证. 丁艺冰,丁雨格,陈凌,王海岗,陈喜明,王瑞云,乔治军. 2022

[15]基于DNA条形码技术对江门沿岸海域夏季鱼卵的鉴定. 张楠,吴娜,郭华阳,朱克诚,刘永,李纯厚,杨静文,江世贵,张殿昌. 2018

[16]黑龙江地区农田害鼠发生特点及DNA条形码鉴定技术的应用. 丛林,王大伟,罗婵,田林,耿远昭,宋英,马晓慧,李宁,刘晓辉. 2018

[17]新疆赛里木湖3种引进白鲑鱼类的DNA条形码分析. 常玉梅,孙博,苏宝锋,梁利群,侯玉军. 2018

[18]筛选金线莲种质资源的通用DNA条形码序列及鉴定其混伪品. 梅瑜,邱道寿,肖深根,彭淼,陈栋. 2019

[19]回捕牙鲆生长和摄食状况调查研究. 宋立民,于清海,袁立来,司飞,任玉芹,任建功,张红涛,李楠. 2019

[20]北京白羊沟景区农林交错带蛾类DNA条形码鉴定. 武宇鹏,范仁俊,曹天文,武春生. 2021

作者其他论文 更多>>

微信小程序