绵羊SMAD4基因克隆、生物信息学分析及组织表达研究

文献类型： 中文期刊

第一作者： 王丹

作者： 王丹;张新玉;付佳棋;贾琪;张双双;崔成都;张立春;孙福亮

作者机构：

关键词： 绵羊;SMAD4基因;克隆;生物信息学;表达

期刊名称： 中国畜牧兽医

ISSN： 1671-7236

年卷期： 2023 年 012 期

页码： 4783-4792

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： 【目的】克隆绵羊SMAD同源物4（SMAD4）基因并探究其在绵羊中的生物学功能，为研究SMAD4基因在毛囊生长发育过程中的调控作用提供依据。【方法】以小尾寒羊皮肤组织cDNA为模板，PCR扩增SMAD4基因CDS区并克隆测序，对其进行生物信息学分析；采用实时荧光定量PCR检测SMAD4基因在小尾寒羊和新吉细毛羊心脏、肝脏、脾脏、肾脏、皮肤和肌肉中的表达量。【结果】试验成功克隆小尾寒羊SMAD4基因CDS区，长1 662 bp,编码553个氨基酸。系统进化树分析显示，绵羊SMAD4基因核苷酸序列与山羊和牦牛的亲缘关系最近，与鸡的亲缘关系最远。生物信息学分析发现，SMAD4蛋白为不含信号肽的非跨膜蛋白，存在磷酸化和糖基化位点，属于亲水性蛋白，主要存在于细胞核中；SMAD4蛋白二级结构以无规则卷曲为主，与三级结构预测结果一致；蛋白互作分析显示，SMAD4蛋白与SMAD2、SMAD1、TGFBR1、TGFBR2、SMAD3等蛋白存在相互作用。实时荧光定量PCR结果显示，SMAD4基因在绵羊中广泛表达；与新吉细毛羊相比，小尾寒羊心脏、脾脏和皮肤中SMAD4基因表达量均显著上升（P＜0.05）,而肺脏和肌肉中SMAD4基因表达量均显著下降（P＜0.05）。【结论】试验成功克隆绵羊SMAD4基因CDS区，该基因在绵羊各组织中均有表达，且在小尾寒羊和新吉细毛羊心脏、脾脏、皮肤、肺脏和肌肉中存在显著差异。试验结果为进一步探究绵羊SMAD4基因调控毛囊发育提供理论依据。

分类号： S826

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