哲罗鱼基因组微卫星富集文库的构建与分析

文献类型： 中文期刊

第一作者： 佟广香

作者： 佟广香;鲁翠云;匡友谊;梁利群;尹家胜;孙效文

作者机构：

关键词： 哲罗鱼;微卫星;磁珠富集

期刊名称： 中国水产科学

ISSN： 1005-8737

年卷期： 2006 年 13 卷 02 期

页码： 181-186

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： 采用磁珠富集法构建哲罗鱼(Hucho taimenPallas)基因组微卫星文库。哲罗鱼基因组DNA经MboI限制性内切酶消化后,选取400~900 bp的片段,用生物素标记的简单重复序列(ACA)15作探针与其杂交,杂交复合物结合到包被有链霉亲和素的磁珠上,获得目的片段,连接T载体克隆,构建基因组微卫星富集文库。再用同位素标记的(ACA)15探针进行二次筛选,筛选出686个阳性克隆,阳性克隆率为35.94%。对其中140个阳性克隆进行测序,共获得149个微卫星序列,4个小卫星序列,其GenBank Accession Number为DQ110955~DQ121108。其中perfect(完美型)62个,占41.61%;imperfect(非完美型)92个,占61.74%;compound(混合型)5个,占3.36%,重复次数主要分布于6~45(81.21%),平均重复次数为32.5,这表明(ACA/TGT)n在哲罗鱼基因组DNA中含量非常丰富。本研究旨为从DNA水平上研究哲罗鱼种群结构、遗传多样性及目前群体现状等方面提供有效工具。

分类号： S917.4

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